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mary0312332

银虫 (小有名气)

[交流] [求助]虚拟筛选

在做虚拟筛选前,想对小分子库做一个初步的筛选,想请教高手,一般应怎么设置参数?如分子中原子数, 键数, 分子量就设500以下还是应该稍大于500一点?疏水位点又应该在什么范围? 因为完全是新手,对于这些参数实在摸不着头脑, 也不知应该从哪里查阅. 请多多指教
感激不尽!
[search]虚拟筛选[/search]

[ Last edited by mary0312332 on 2009-4-8 at 16:18 ]
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wwbkevin

至尊木虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
一般遵从Lipinski定性规则
Lipinski's Rule of Five states that, in general, an orally active drug has:
Not more than 5 hydrogen bond donors (OH and NH groups)
Not more than 10 hydrogen bond acceptors (notably N and O)
A molecular weight under 500 g/mol
A partition coefficient log P less than 5
gui
2楼2008-03-28 22:19:51
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