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如何使用Mege4建立系统进化树
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美丽的家园
金虫
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专业: 环境分析化学
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]
如何使用Mege4建立系统进化树
已有3人参与
从ncbi下载与要鉴定的物种相似的序列用记事本保存为fasta格式,Mege却没办法查找到这些文档,故而打不开。具体该如何使用操作,望赐教
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shiyanjishu
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1楼
2014-05-24 00:07:43
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laneldarye
铜虫
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专业: 病原细菌与放线菌生物学
【答案】应助回帖
楼上说的clustalX比对再mega是对的
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7楼
2014-08-10 12:35:36
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woaixiaopei
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注册: 2013-11-27
性别: GG
我也想学学~
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志存高远把握当下永不气馁鹏程万里
2楼
2014-05-24 00:09:02
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gyesang
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分子生物
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
美丽的家园: 金币+5
2014-05-25 18:41:06
先用clustalX进行序列比对,会产生一个.phd的文件,用mega打开这个文件就可以了
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3楼
2014-05-24 20:50:37
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wizardfan
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专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
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美丽的家园: 金币+5,
★
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2014-05-25 18:32:15
kx444555: 金币+2, 鼓励交流
2014-05-25 20:05:36
因为fasta只是普通的序列格式,而MEGA需要的是多序列比对文件,最常用的就是clustal系列进行这个转换,clustalx是带图形界面的,而clustalw是命令行,随便你选
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4楼
2014-05-25 00:08:58
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