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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 能否给我解答下什么是周期性系统和非周期性系统啊？
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peerlesszjh

新虫 (小有名气)

[求助] 能否给我解答下什么是周期性系统和非周期性系统啊？ 已有1人参与

什么是周期性系统 什么是非周期性系统啊 ？？？  有什么区别  举些例子啊
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1楼 2014-05-23 20:25:52
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peerlesszjh

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 田淮安 at 2014-05-26 10:25:59
我把你这里的“系统”理解为一个一定空间内原子的集合，比如一块晶体。
抄一段LAMMPS手册关于周期性边界的解释
The style p means the box is periodic, so that particles interact across the boundary, and th ...

恩呢 这是边界性条件嘛  如果我 build  polymer建立一个聚合物 那他就不是周期性系统咯  是不是我把这polemer 放在AC construction  建立个盒子那么它就是周期性系统了阿？？ 我不知道我的理解对不对
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3楼2014-05-26 10:29:44
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田淮安

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-05-30 19:45:00
我把你这里的“系统”理解为一个一定空间内原子的集合，比如一块晶体。
抄一段LAMMPS手册关于周期性边界的解释
The style p means the box is periodic, so that particles interact across the boundary, and they can exit one end of the box and re-enter the other end.
大意就是，周期性系统（假设系统是一个长方体的盒子）在前后左右上下有6个一模一样的盒子与它相邻，边界处连续并且有相互作用。举例来说，假设该盒子中一个原子向上运动并离开上表面，那么它会从下表面重新进入盒子；如果一直运动，那就这样一直循环。
作为对比，非周期性系统就是一个独立的盒子，周围都是真空。如果该盒子中一个原子向上运动并离开表面，那它就永远离开了，不会从下表面重新进入。
这只是我的理解，希望有帮助。
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行到水穷处，坐看云起时。
2楼2014-05-26 10:25:59
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田淮安

新虫 (初入文坛)
★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-30 19:45:05
引用回帖:
3楼: Originally posted by peerlesszjh at 2014-05-26 10:29:44
恩呢 这是边界性条件嘛  如果我 build  polymer建立一个聚合物 那他就不是周期性系统咯  是不是我把这polemer 放在AC construction  建立个盒子那么它就是周期性系统了阿？？ 我不知道我的理解对不对...

我不太熟悉化学大分子的建模。根据固体物理知识，要想一个单元在空间内周期性的无缝排列，这个单元必须满足一定的几何条件，也就是布拉格晶系，常见的就是立方晶系、三斜晶系等。你把聚合物的重复单元放到一个盒子里，再采用周期性边界，就能得到一个周期性系统了。只在一个方向设置周期性边界，就能得到一维链状大分子；同理，在两个或三个方向上设置，就能得到平面分子或三维晶体。具体盒子怎么设置，应该由你的聚合物决定吧。我没试过，但原理应该就是这样。
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行到水穷处，坐看云起时。
4楼2014-05-26 16:23:30
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