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paopaotu326

金虫 (正式写手)

[求助] 差分电荷密度图的疑惑 已有6人参与

大家好:
     我是新手,刚学着做差分电荷密度,作出来的图如下所示:
    我做的是掺杂体系,要看掺杂前后的电荷密度变化,我是分别计算出三个CHGCAR后直接在VESTA中相减的到的图片,不知道这个怎么分析啊?只知道红色区域表示电荷密度增大,蓝色减少,形成的键就不知道了,没学过量字化学啊,求高手帮忙下;
    第二个问题就大了,同样的三个CHGCCAR文件,在linix系统中用脚本CHGdiff.pl来依次相减,就是ABC-A,得到一个结果,再用它-C=chgdiff,放在vesta中显示,才好玩,和直接在vesta里相减得出的图完全不一样,如第二张图,这是怎么回事?
    我的体系是在SnO2中用Pd原子取代Sn原子形成的。

差分电荷密度图的疑惑
CHGCAR_vesta.jpg


差分电荷密度图的疑惑-1
CHGCAR.jpg
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paopaotu326

金虫 (正式写手)

回楼上:
      我的体系是O的2p电子和Pd的4d电子的杂化,这个比较明确,至于Sn-O之间的杂化已经很清楚,不用再多分析,就是这个Pd-O之间的杂化比较复杂,有的文献报道是有PI键,也有西格玛键,不是太明白,就照着分析吧,呵呵:)没有学过固体化学、分子轨道的知识啊,打算一遍学习一边分析了,能学习到什么程度就到什么程度,尽力而为罢了
28楼2014-06-16 11:57:15
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paopaotu326

金虫 (正式写手)

补充下第一张图的标尺,最上面是:0.1,最下面是-0。25
2楼2014-05-23 08:56:54
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paopaotu326

金虫 (正式写手)

第三个疑惑,如果想把所获得的CHGCAR文件放在lev00里面处理,最后放在origin中作图,有个很大的问题,就是用lev00程序的时候,一开始就需要输入:outcar文件和contcar文件,之后才输入chgcar文件,那么最后输入的chgcar文件就用三个CHGCAR相减得到的差,可是前面地 outcar 和contcar该输入哪个?是ABC的,还是B的,或者C的? 我的理解是计算的时候三个东东的空间格子都建立的是一样的,NGX、NGY和NGZ也一样,那么是不是输入ABC的outcar和contcar就行了?
3楼2014-05-23 09:01:55
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paopaotu326

金虫 (正式写手)

求帮忙啦,不然难毕业啦,吼吼              
4楼2014-05-23 09:02:46
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