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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 差分电荷密度图的疑惑
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paopaotu326

金虫 (正式写手)

[求助] 差分电荷密度图的疑惑 已有6人参与

大家好：
     我是新手，刚学着做差分电荷密度，作出来的图如下所示：
    我做的是掺杂体系，要看掺杂前后的电荷密度变化，我是分别计算出三个CHGCAR后直接在VESTA中相减的到的图片，不知道这个怎么分析啊？只知道红色区域表示电荷密度增大，蓝色减少，形成的键就不知道了，没学过量字化学啊，求高手帮忙下；
    第二个问题就大了，同样的三个CHGCCAR文件，在linix系统中用脚本CHGdiff.pl来依次相减，就是ABC－A，得到一个结果，再用它－C＝chgdiff，放在vesta中显示，才好玩，和直接在vesta里相减得出的图完全不一样，如第二张图，这是怎么回事？
    我的体系是在SnO2中用Pd原子取代Sn原子形成的。

差分电荷密度图的疑惑
CHGCAR_vesta.jpg


差分电荷密度图的疑惑-1
CHGCAR.jpg
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1楼 2014-05-23 08:55:31
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clown9111014

银虫 (小有名气)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-06-10 09:11:45
引用回帖:
22楼: Originally posted by paopaotu326 at 2014-06-05 16:10:06
谢谢楼上，我已经做了布居数分析，得出结论，Pd-O间的确以共价键为主，而Sn-O则以离子键为主。现在的问题是这个共价键是什么类型？σ键？π键？在哪个部位？哪些原子之间形成？我自己有了判断，但不确定对不对啊，哈 ...

对于σ键和π键我也纠结过，想给一个定性分析，但是我感觉不是太容易界定。首先你要看两个原子是怎么成键的，如果两个原子的s和p轨道都参与杂化，那么电子云的形状不好分析，无法判定。我感觉要是比较间的强弱可以比较电荷的累计在原子间，或者用差分电荷比较。我也是自己理解，仅供参考。
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努力学习 必有所获
27楼2014-06-09 20:17:55
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paopaotu326

金虫 (正式写手)
补充下第一张图的标尺，最上面是：0.1,最下面是－0。25
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2楼2014-05-23 08:56:54
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paopaotu326

金虫 (正式写手)
第三个疑惑，如果想把所获得的CHGCAR文件放在lev00里面处理，最后放在origin中作图，有个很大的问题，就是用lev00程序的时候，一开始就需要输入：outcar文件和contcar文件，之后才输入chgcar文件，那么最后输入的chgcar文件就用三个CHGCAR相减得到的差，可是前面地 outcar 和contcar该输入哪个？是ABC的，还是B的，或者C的？ 我的理解是计算的时候三个东东的空间格子都建立的是一样的，NGX、NGY和NGZ也一样，那么是不是输入ABC的outcar和contcar就行了？
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3楼2014-05-23 09:01:55
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paopaotu326

金虫 (正式写手)
求帮忙啦，不然难毕业啦，吼吼              
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4楼2014-05-23 09:02:46
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