24小时热门版块排行榜    

查看: 1350  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

埃菲尔great

铁虫 (初入文坛)

[求助] 有什么算法可以从MOL2文件中识别出芳香环 已有3人参与

目前正在写一个程序,想要识别一个分子中所有芳香环的位置和他们对应的原子。分子是以MOL2格式保存的。
我想肯定有成熟的算法完成这个工作,但没能搜索到。
所以来问一下。
回复此楼
科研
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

埃菲尔great

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by kekexiliwolf at 2014-05-21 09:00:32
找个二维相似性算法或者程序一筛就出来了,或者用pipeline

Technology[edit]
Pipeline (computing), a chain of data-processing stages or a CPU optimization found on
Classic RISC pipeline, a five stage hardware based computer instruction set.
Pipeline (software), a chain of data-processing processes or other software entities
Graphics pipeline, the method of rasterization-based rendering as supported by graphics hardware
Pipeline (Unix), a set of process chained by their standard streams
XML pipeline, a connection of XML transformations
Telestream pipeline, a video capture and playout hardware device
Sales pipeline, a visualisation of the sales process of a company
The Pipeline, a former internet service provider
Pipelining (DSP implementation), a transformation for optimizing digital circuit.
我搜了PIPELINE,只有这个。
能详细讲一下么
科研
6楼2014-05-22 22:06:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2014-05-30 19:28:14
貌似VMD 就能识别mol2文件吧?
如果可以,还要啥程序啊,直接VMD 就可以搞定。
2楼2014-05-20 23:01:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

埃菲尔great

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-05-20 23:01:53
貌似VMD 就能识别mol2文件吧?
如果可以,还要啥程序啊,直接VMD 就可以搞定。

VMD识别了只能肉眼看,我想批量自动处理出来用来做接下来的研究
科研
3楼2014-05-21 00:38:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-05-30 19:28:21
找个二维相似性算法或者程序一筛就出来了,或者用pipeline
我们在为了文章而搞科研
4楼2014-05-21 09:00:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 22:18 by xxniao123
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +7 苏东坡二世 2026-08-23 7/350 2026-08-27 18:14 by 瞬息宇宙
[基金申请] 基金不中,共勉 +10 eulota 2026-08-26 10/500 2026-08-27 17:23 by lqllinqiaoli
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+5) +10 晴天加油 2026-08-26 11/550 2026-08-27 16:35 by msuhlx
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见