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埃菲尔great

铁虫 (初入文坛)

[求助] 有什么算法可以从MOL2文件中识别出芳香环 已有3人参与

目前正在写一个程序,想要识别一个分子中所有芳香环的位置和他们对应的原子。分子是以MOL2格式保存的。
我想肯定有成熟的算法完成这个工作,但没能搜索到。
所以来问一下。
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科研
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埃菲尔great

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-05-20 23:01:53
貌似VMD 就能识别mol2文件吧?
如果可以,还要啥程序啊,直接VMD 就可以搞定。

VMD识别了只能肉眼看,我想批量自动处理出来用来做接下来的研究
科研
3楼2014-05-21 00:38:55
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2014-05-30 19:28:14
貌似VMD 就能识别mol2文件吧?
如果可以,还要啥程序啊,直接VMD 就可以搞定。
2楼2014-05-20 23:01:53
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kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-05-30 19:28:21
找个二维相似性算法或者程序一筛就出来了,或者用pipeline
我们在为了文章而搞科研
4楼2014-05-21 09:00:32
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smutao

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-05-30 19:28:25
本帖内容被屏蔽

5楼2014-05-21 13:22:37
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