应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 求助各位虫虫，有没有人知道如何从蛋白质氨基酸序列来推测基因序列的研究手段
91/1返回列表
查看: 3291  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 2 个 BioEPI ，点击这里进行查看

樱花有泪

银虫 (小有名气)

[求助] 求助各位虫虫，有没有人知道如何从蛋白质氨基酸序列来推测基因序列的研究手段 已有5人参与

RT，通过分离得到的蛋白，如何能得到编码其的基因序列？PS，该物种全基因组已经测序。
各位虫虫不吝赐教！！！！！！！！！！！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子生物科研

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-05-20 18:26:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Titanic416

银虫 (知名作家)

北京方便面真方便

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
silicare: 金币+3, BioEPI+1, 谢谢参与 2014-06-11 10:49:00
建议楼主BLAST，将蛋白质的氨基酸序列，直接转换成对应的可能的核酸序列。在NCBI网站就可以。或者百度Blast，有详细的操作方法。另外，，你那个不是基因序列已经都测定了吗？用个翻译软件，翻译一下，将所得的氨基酸序列与你的序列比对下就可以了吧。希望可以帮到你。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下(1人) 回复此楼
阳光总在风雨后，请相信有彩虹！
2楼2014-05-20 18:35:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
去NCBI用tblastn， http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome， 可以选择你所用的species来限定结果
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2014-05-20 19:38:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

樱花有泪

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wizardfan at 2014-05-20 19:38:18
去NCBI用tblastn， http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=tblastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome， 可以选择你所用的species来限定结果

首先非常感谢你的回答，然后我想请教一下，N端测序测序能够像核酸测序一样，知晓每条多肽链的氨基酸组成，然后，tblastn的准确性又有多高？
赞一下 回复此楼
4楼2014-05-25 20:13:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
silicare: 金币+5, BioEPI+1, 应助指数+1, 谢谢参与 2014-06-11 10:47:51
1. 分离得到的蛋白如果不知道其序列，需要先测定起序列
2. 把你的蛋白进行Blast，获得其他物种的同源蛋白，并对这些蛋白进行比对
3. 找出蛋白的进化保守序列，设计兼并引物
4. 运用兼并引物在你的物种中扩增其编码基因序列
赞一下 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2014-05-25 23:11:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kinple
6楼2014-05-25 23:35:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangzhb2009

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
7楼2014-05-26 00:23:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主
引用回帖:
4楼: Originally posted by 樱花有泪 at 2014-05-25 20:13:45
首先非常感谢你的回答，然后我想请教一下，N端测序测序能够像核酸测序一样，知晓每条多肽链的氨基酸组成，然后，tblastn的准确性又有多高？...

tblastn的准确度和其他BLAST程序是一样的。
不懂你说的“N端测序测序”，我就知道通过质谱可以做de novo，但是这个准确度不是太高，比如无法区分I和L
赞一下 回复此楼
8楼2014-05-26 04:48:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
silicare: 金币+2, 应助指数+1, 谢谢参与 2014-06-11 10:49:14
请参阅Cui et al. MOLECULAR REPRODUCTION AND DEVELOPMENT 71:19–28 (2005)。是你想要的！！
赞一下 回复此楼
9楼2014-05-26 06:53:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 樱花有泪 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +16 koalala 2026-08-24 18/900 2026-08-24 15:43 by zhuzg0628
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 18/900 2026-08-24 12:03 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +12 kulium 2026-08-21 15/750 2026-08-24 12:02 by iaeyuan
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 什么时候开奖？ +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭