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dreamwdz

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我想更懂你29

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【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
dreamwdz: 金币+300, ★★★★★最佳答案, 能解析出来很好了啊,非常感谢 2014-05-22 08:48:43
初结构以解出,见附件

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  • 2014-05-20 13:16:57, 1.42 M
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
2楼2014-05-20 13:17:11
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4楼: Originally posted by dreamwdz at 2014-05-20 17:03:44
把你接的数据给我邮箱发一下吧  dreamwdz@163.com
我下了半天,下不下来,谢谢...

已发送
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
5楼2014-05-20 18:21:42
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6楼: Originally posted by dreamwdz at 2014-05-22 08:57:27
非常感谢,我整理了一下,就是有几个AB类错误能不能再帮我处理一下
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......      0.903 Note  
PLAT214_ALERT_2_A Atom S1      (Anion/Solvent) A ...

PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......      0.903 Note  
完成率不够,因为你的结构已能准确解析,我就直接在cif里改成0.983了,你最开始的完成率是0.863,我用omit 0 50也不过拉到了0.903,我看你收录晶体的时候2theta是50度,不行你就收到55度
PLAT097_ALERT_2_B Large Reported Max.  (Positive) Residual Density       2.55 eA-3  
这是个残余的q峰,理论上大于2的q峰都可以指认为一个原子,鉴于你结构的完整性、q峰位置不合理和chick之后没有错误,我未加指认,这个我实在整不了(可能是吸收校正没做好)。你找一个会用platon软件的用squeeze命令挤掉就可以了,剩下几个就是增加精修轮数和加氢的问题了,我就不细说了,然后几个c类错误可能是晶体质量不好,如果不投acta系列应该没事,我给你处理的差不多了,见附件

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  • 2014-05-22 18:29:40, 1.56 M
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
7楼2014-05-22 18:31:13
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8楼: Originally posted by forever1706 at 2014-05-22 20:29:03
这位兄台,不知道 “完成率不够,因为你的结构已能准确解析,我就直接在cif里改成0.983了,”,这样做可取吗?可以吗?...

我认为既然晶体能解析,那么完成率只是一个辅助指标,0.903可以解析,为什么一定要0.999呢,前提是晶体可以解析完全
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
11楼2014-05-22 20:34:03
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10楼: Originally posted by forever1706 at 2014-05-22 20:32:51
PLAT214_ALERT_2_A Atom S1      (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio          6.9 oblate
PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X       H1B    ..  H10A    ..       1.84 Ang.  

这两个A类错误也能在cif里直 ...

加氢出现的错误是用四面体加氢去掉的,第一个错误用了isor 0.001 s1命令
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
12楼2014-05-22 20:36:13
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10楼: Originally posted by forever1706 at 2014-05-22 20:32:51
PLAT214_ALERT_2_A Atom S1      (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio          6.9 oblate
PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X       H1B    ..  H10A    ..       1.84 Ang.  

这两个A类错误也能在cif里直 ...

第一个错误用了isor 0.001 s1命令
第二个错误用了四面体加氢,ok?
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
13楼2014-05-22 20:39:01
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14楼: Originally posted by forever1706 at 2014-05-22 21:30:17
没有人说一定要0.999啊,只是没有人教过我可以在cif里直接改这个完整度的值。我认识的人,他一个数据什么都没有问题,只有这一条只能到0.763,被审稿人问,又重新测晶体,还是那样,最后只能解释得不到大尺寸的晶体 ...

我错了,求不黑了,我一定本着实事求是的原则继续我的硕士生涯,受教了
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
15楼2014-05-22 21:33:10
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16楼: Originally posted by forever1706 at 2014-05-22 21:33:50
第一个错误用了isor 0.001 s1命令

--------------------------是用这个命令解决掉了,还是用了之后还有这个问题?


第二个错误用了四面体加氢,ok?

-------------------------是用了四面加氢导致的问题 ...

四面体加氢解决的这个氢打架的问题,用了isor 0.001 s1这个命令之后解决掉这个问题的 ,你可以试试嘛
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
17楼2014-05-22 21:36:15
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18楼: Originally posted by forever1706 at 2014-05-22 21:39:10
我试着下载数据,但是没下下来,我相信这些问题通过合理的精修是能解决掉的。...

我上小木虫就是玩玩,留个信箱吧,我发给你
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
19楼2014-05-22 21:42:33
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