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启动子分析
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请问：我拿到了几个序列，推测为启动子序列，我该怎样通过启动子数据库搜索它们属于那个或那类基因的启动子呢？ 例如学列如下： GTCGCCTCGACCCACTTGGTGAAATAATCTATCGCCACGAGAATGAAGCGATGACCGTTCGAAGCCTTGGGCTCGATGGCCCTGATGACATCTATTCCCCACATGGAAAAAGGCCAAGGGGCGAACATGACATTTAGAGGATGCGGCGGAGCATTGACATTATCCGCGAACGCTTGACACTTGTGGCATTTCCTTACATGGACGCAGCAATCACCTTCCATGGTGAGCCAGTAATAACCTGCCCTCAGGATCTTCCTGGCCATAGCATGTCCATTGGCGTGCGTTTCAAATGAACCCTCGTGGACTTCCTCGATCATGTGGTTCGCCTCTTTGGTATCCATGCATCGCATGAGAGTCATATCGTGGTTTCTTTTATATAGTATGCTCCTGCTCATGAAGAAACTGGCCGCCAATCTCCTCATTGTCGAAGGTCTCCGGTGGGTACTCTTTGTTTTCGACATATCGCTTGATATTGAAATACCAAGGCTTACCGTCCCGTTCCTCTTCTACTTGGCAGCAATGCGCAGGTTTGCCATGACACCAAAATTCAATGTAGGGTAAATCCCCGTGCGGCGTTAGCTGGAACATAGATGCCAAAGTAGCAAGCGCATCCGCCATTTGATTTTCCTCGCGGGGAACATGATGGAAAGAGATCTCATCAAAGGTTTTAGCCAATTCCTTGATATAGGCTTTGTAGGGTATCAGCTTGGGATCTCTAGTTTCCCATTCCCCTCTCAGCTGATGGATTACCAACGCGGAGTCGCCGTACACCTTGAGTAGGGATGCATGGGCTGATAGTCGTTGAGAGGCTGCTGAGCCAAA |
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有启动子分析网站，可以分析转录起始位点和一序列的盒子，我以前作过，http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html 你若找基因，可以上NCBI比对，可能会有收获。 密切注视你的进展！ [ Last edited by annwt on 2008-3-16 at 22:34 ] |
2楼2008-03-16 22:25:30
lauren180
木虫 (著名写手)
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- 专业: 环境微生物学
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给你几个常用的启动子分析网页 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/ http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalscan.html http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html |
3楼2008-03-16 22:29:16
