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dh210600

新虫 (初入文坛)

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[交流] 启动子分析

请问：我拿到了几个序列，推测为启动子序列，我该怎样通过启动子数据库搜索它们属于那个或那类基因的启动子呢？
例如学列如下：
GTCGCCTCGACCCACTTGGTGAAATAATCTATCGCCACGAGAATGAAGCGATGACCGTTCGAAGCCTTGGGCTCGATGGCCCTGATGACATCTATTCCCCACATGGAAAAAGGCCAAGGGGCGAACATGACATTTAGAGGATGCGGCGGAGCATTGACATTATCCGCGAACGCTTGACACTTGTGGCATTTCCTTACATGGACGCAGCAATCACCTTCCATGGTGAGCCAGTAATAACCTGCCCTCAGGATCTTCCTGGCCATAGCATGTCCATTGGCGTGCGTTTCAAATGAACCCTCGTGGACTTCCTCGATCATGTGGTTCGCCTCTTTGGTATCCATGCATCGCATGAGAGTCATATCGTGGTTTCTTTTATATAGTATGCTCCTGCTCATGAAGAAACTGGCCGCCAATCTCCTCATTGTCGAAGGTCTCCGGTGGGTACTCTTTGTTTTCGACATATCGCTTGATATTGAAATACCAAGGCTTACCGTCCCGTTCCTCTTCTACTTGGCAGCAATGCGCAGGTTTGCCATGACACCAAAATTCAATGTAGGGTAAATCCCCGTGCGGCGTTAGCTGGAACATAGATGCCAAAGTAGCAAGCGCATCCGCCATTTGATTTTCCTCGCGGGGAACATGATGGAAAGAGATCTCATCAAAGGTTTTAGCCAATTCCTTGATATAGGCTTTGTAGGGTATCAGCTTGGGATCTCTAGTTTCCCATTCCCCTCTCAGCTGATGGATTACCAACGCGGAGTCGCCGTACACCTTGAGTAGGGATGCATGGGCTGATAGTCGTTGAGAGGCTGCTGAGCCAAA

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1楼 2008-03-16 22:18:39

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annwt

木虫 (正式写手)

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★
reasonspare(金币+1,VIP+0):xiexie 关注,.

有启动子分析网站，可以分析转录起始位点和一序列的盒子，我以前作过，http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/
http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html

你若找基因，可以上NCBI比对，可能会有收获。
密切注视你的进展！

[ Last edited by annwt on 2008-3-16 at 22:34 ]