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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps命令如何修改以及解释，旧版是fix 2 all msd 100 diff.out
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朱雪刚521

铁杆木虫 (知名作家)

[求助] lammps命令如何修改以及解释，旧版是fix 2 all msd 100 diff.out 已有1人参与

fix                1 all npt temp 300 300 0.1 couple xyz iso  0  0  0.1
fix             2 all msd 100 diff.out
fix             3 all rdf 100 rdf.out 100 1 1

三个命令，第一个知道是温度，坐标。……等
第二行命令在手册上没找到，是什么意思贴别是msd  
第三行的rdf是什么意思，
现在运行，显示invalid fix style。
求大神解就，急用，
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1楼 2014-05-15 21:47:31
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老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
朱雪刚521: 金币+20, ★有帮助, 谢谢指点。 2014-05-16 15:15:14
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-05-16 20:21:29
MSD是均方位移。RDF是径向分布函数。你应该先学习MD基本知识，再学习软件。
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2楼2014-05-16 08:12:50
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朱雪刚521

铁杆木虫 (知名作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 老虎大王 at 2014-05-16 08:12:50
MSD是均方位移。RDF是径向分布函数。你应该先学习MD基本知识，再学习软件。

谢谢指点，MD基础请您推荐些。程序可是我现在运行不了，先求解觉方法。也就是说我现在还没搞清楚问题出在哪里，怎么改就能运行了。
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3楼2014-05-16 11:51:08
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老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
朱雪刚521: 金币+10, ★有帮助, 没这个命令，知道他做什么，用其他命令能换不？ 2014-05-16 15:17:38
朱雪刚521: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 6楼才是关键，尝试中非常感谢。 2014-05-16 16:02:49
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-05-16 20:21:49
ix             2 all msd 100 diff.out
fix             3 all rdf

没有这两个命令。
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4楼2014-05-16 15:03:29
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朱雪刚521

铁杆木虫 (知名作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 老虎大王 at 2014-05-16 15:03:29
ix             2 all msd 100 diff.out
fix             3 all rdf

没有这两个命令。

我也是找不到命令才求助的。看来得问作者了。
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5楼2014-05-16 15:14:23
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老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 应助指数+1, 感谢指导！ 2014-05-16 20:22:23
引用回帖:
5楼: Originally posted by 朱雪刚521 at 2014-05-16 15:14:23
我也是找不到命令才求助的。看来得问作者了。...

现在改为Compute了。
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6楼2014-05-16 15:23:50
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朱雪刚521

铁杆木虫 (知名作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 老虎大王 at 2014-05-16 15:23:50
现在改为Compute了。...

谢谢，楼主，我尝试一下。
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7楼2014-05-16 16:02:00
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