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tongxiaoxue

铁虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 11.5
帖子: 100
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虫号: 553523
注册: 2008-05-03
专业: 微生物遗传育种学

[求助] 求助使用Rosetta design 的时候如何提交Resfile文件？非常感谢！

各位虫友，帮帮忙吧，我忙了一下午，也没有成功，作为刚刚使用Rosetta design的新手，真的觉得很沮丧。。。

我的PDB file 包含272氨基酸，而我只想改造其中26个氨基酸，而这26个氨基酸可以重新设计为其他任何的20个氨基酸。

首先我在这个网上http://rosettadesign.med.unc.edu/提交了AEM.pdb file。
然后准备提交Resfile （26.resfile）。这个file是我先建了一个txt file。然后我重新命名为26.resfile。这样可以吗？
我的26.resfile
NATRO
START
25 ALLAA
26 ALLAA
27 ALLAA
28 ALLAA
29 ALLAA
30 ALLAA
35 ALLAA
37 ALLAA
38 ALLAA
很简单的命令。但是提交到网上，总是显示操作失败。
用过rosettadesign重新设计蛋白序列的前辈们，给我一些指导吧。感激不尽！！
再次感谢！

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