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tongxiaoxue

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助使用Rosetta design 的时候如何提交Resfile文件?非常感谢!

各位虫友,帮帮忙吧,我忙了一下午,也没有成功,作为刚刚使用Rosetta design的新手,真的觉得很沮丧 。。。

我的PDB file 包含272氨基酸,而我只想改造其中26个氨基酸,而这26个氨基酸可以重新设计为其他任何的20个氨基酸。

首先我在这个网上http://rosettadesign.med.unc.edu/提交了AEM.pdb file。
然后 准备提交Resfile (26.resfile)。 这个file是我先建了一个txt file。然后我重新命名为26.resfile。这样可以吗?
我的26.resfile
NATRO
START
25 ALLAA
26 ALLAA
27 ALLAA
28 ALLAA
29 ALLAA
30 ALLAA
35 ALLAA
37 ALLAA
38 ALLAA
很简单的命令。但是提交到网上,总是显示操作失败。
用过rosettadesign重新设计蛋白序列的前辈们,给我一些指导吧。感激不尽!!
再次感谢!
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reinecao

木虫 (著名写手)


楼主现在还在做蛋白设计吗

发自小木虫IOS客户端
2楼2017-03-07 00:28:27
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