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pdl9527专家顾问 (小有名气)
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MS的Dmol3模块COSMO计算的问题。 已有1人参与
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我在别的区提过了,没人解答。。。。 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7397241 |
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19楼2014-10-13 14:53:40
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gkf高: 金币+4 2014-05-13 16:14:05
gkf高: 金币+4 2014-05-13 16:14:05
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虽然我对溶剂化了解的不多,昨天刚刚和人讨论过这个问题,赶上得很是时候。 ppt结尾引用了文献Klamt, Andreas, G. Shüürmann的,这个似乎对应的是Dmol3老的溶剂化计算方法(Dmol3的help能够查到),这种方法计算sigma的时候和新方法(默认的ibs)不一样,我们发觉空穴孔洞面积确实不同。如果要在Dmol3中实现Klamt方法,应该先保存input文件(Dmol3 Calculations-(其他参数设定完成)-Files-save files,然后产生input文件),然后把COSMO那一行的ibs修改成on,然后在Dmol3 Calculations-Files-run files运行。 即便这样,我不太确定每个原子的溶剂化半径在两个程序(你给出的ppt和Dmol3)中是否相同。不过仍旧建议你做个测试进行比较。 |

2楼2014-05-13 13:16:48
pdl9527
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不好意思我那个附件传错了,这地方又传看一边:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7402423 请在帮忙看看,他的COSMO是ON的状态的~ |
3楼2014-05-13 18:25:45
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4楼2014-05-13 19:59:31









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