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seadog2007新虫 (小有名气)
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【请教】Agilent 的miRNA表达谱芯片 分析方法？
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大家好！ 课题组近期收到公司反馈回的miRNA表达谱芯片（Agilent 公司的 Human miRNA Microarray, Release 19.0, 8x60K 芯片）文件，TXT格式的原始数据。 样本量为10例对照，44例肿瘤。 特此请教一下，如何着手做质控、背景校正、标准化、汇总及差异表达分析等内容？ 在网上看到很多资料选用的都是Affy（昂飞）公司的芯片，但好像不能直接迁移其分析模式。（原始数据格式不同，用到的R/bioconductor包也不同） 特此请教一下，最好能指点一下【分析Agilent的miRNA芯片】需要用到哪些包？ 如能提供一些【分析Agilent的miRNA芯片】的学习或参考资料及链接，也万分感谢！ |
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