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蔚蓝之枫

木虫 (小有名气)

[交流] 羧基配位及电荷平衡问题

本人有一个晶体,酸配体为单齿配位,配位的羧基C-O键长为1.18,未配位的羧基键长为1.28,根据键长未配位的羧基上应该有个H
但晶体中的金属原子占有率为1,应为+2价,金属上配了两个羧基,如果羧基都去质子化的话刚好电荷平衡,所以现在不知道该如何判断,去各位大侠出手相助!
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
蔚蓝之枫: 金币+10 2014-05-11 23:09:23
首先你要知道,两个C-O键长差0.1埃可以认定为离域,即羟基的氢脱掉了,另外,你要看一下未配位的羧基氧的环境,是不是有其他的氢键给体与其形成了氢键,从而使其未参与配位,第三,如果没有其他原子参与形成氢键,那就要看看该羧基氧是否与金属配位,比如铜离子的姜泰勒效应使得其形成的两个较长的键在shelxtl里看不到。
4楼2014-05-11 19:53:03
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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7楼: Originally posted by 蔚蓝之枫 at 2014-05-11 23:19:49
谢谢老师的指导!那如果二价铜占有率为0.5,其上配了两个羧基,一个Cu-O键长2.76,一个Cu-O键长1.96,电荷还平衡吗?...

你的两个铜氧键长都合理,主要看羧基的C-O键长是多少,因为两个羧基不是对称操作得到的,所以可能存在一个脱质子,而另一个还保留H质子。
9楼2014-05-12 08:12:47
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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13楼: Originally posted by 蔚蓝之枫 at 2014-05-12 13:04:02
怎么看两个羧基的对称操作关系
...

比如说,你看你的羧基是O1,O2和O3,O4还是都是一样的O1,O2
14楼2014-05-12 21:07:48
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

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16楼: Originally posted by 蔚蓝之枫 at 2014-05-13 10:16:44
老师 还有一个问题,就是铜离子存在姜泰勒效应,那么怎么判断铜离子上的羧酸是单齿配位还是双齿螯合配位呢?...

主要是看铜离子与氧原子形成的键长,能形成合理的键长就可以。

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18楼2014-05-13 12:56:48
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gongwei924

金虫 (正式写手)

九五之尊

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
蔚蓝之枫: 金币+10 2014-05-11 23:06:54
有时候不能单单根据C-O键长来判定与金属配位的是羰基上的O还是羟基上的O。因为与金属配位有可能导致C-O键长发生改变了,而且从你提供的键长来看,相差并不多,很可能与金属配位的就是羟基上的O。电荷还是平衡的。不要多想。
2楼2014-05-11 14:41:01
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
蔚蓝之枫: 金币+10, 谢谢!非常有用 2014-05-11 23:09:15
首先考虑电荷平衡,在你的这种情况下,似乎不宜加氢。
老歪博
3楼2014-05-11 19:15:40
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蔚蓝之枫

木虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by gongwei924 at 2014-05-11 14:41:01
有时候不能单单根据C-O键长来判定与金属配位的是羰基上的O还是羟基上的O。因为与金属配位有可能导致C-O键长发生改变了,而且从你提供的键长来看,相差并不多,很可能与金属配位的就是羟基上的O。电荷还是平衡的。不 ...

谢谢您的指导!那如果金属的占有率为0.5的话,配上两个羧基,电荷还平衡吗?
5楼2014-05-11 23:08:40
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gongwei924

金虫 (正式写手)

九五之尊


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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5楼: Originally posted by 蔚蓝之枫 at 2014-05-11 23:08:40
谢谢您的指导!那如果金属的占有率为0.5的话,配上两个羧基,电荷还平衡吗?...

这个既然形成配合物,你肯定要按照合理的说法去解释。占有率是多少先搞清楚。不能一会是1一会是0.5滴。。。

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-05-11 23:12:01
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蔚蓝之枫

木虫 (小有名气)

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4楼: Originally posted by jackdeng at 2014-05-11 19:53:03
首先你要知道,两个C-O键长差0.1埃可以认定为离域,即羟基的氢脱掉了,另外,你要看一下未配位的羧基氧的环境,是不是有其他的氢键给体与其形成了氢键,从而使其未参与配位,第三,如果没有其他原子参与形成氢键,那 ...

谢谢老师的指导!那如果二价铜占有率为0.5,其上配了两个羧基,一个Cu-O键长2.76,一个Cu-O键长1.96,电荷还平衡吗?
7楼2014-05-11 23:19:49
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蔚蓝之枫

木虫 (小有名气)

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6楼: Originally posted by gongwei924 at 2014-05-11 23:12:01
这个既然形成配合物,你肯定要按照合理的说法去解释。占有率是多少先搞清楚。不能一会是1一会是0.5滴。。。
...

占有率搞清楚了,我还有一个晶体是这种情况,就想问问您
8楼2014-05-11 23:22:59
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蔚蓝之枫

木虫 (小有名气)

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9楼: Originally posted by jackdeng at 2014-05-12 08:12:47
你的两个铜氧键长都合理,主要看羧基的C-O键长是多少,因为两个羧基不是对称操作得到的,所以可能存在一个脱质子,而另一个还保留H质子。...

老师 一个C-O键长为1.224一个为1.261

[ 发自小木虫客户端 ]
10楼2014-05-12 10:37:43
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