| 查看: 671 | 回复: 0 | ||
[求助]
amber里用evb的力场去跑质子转移的minimization
|
|
amber里 可以用evb的力场去跑质子转移的minimization吗？有人做过么？为什么我的输出文件 mr.out mp.out evbout 均没跑完就停止了，而且最后说： NSTEP ENERGY RMS GMAX NAME NUMBER 114 -8.0177E+05 6.1213E+02 9.4146E+02 C3 2496 BOND = 77.0831 ANGLE = 71.0967 DIHED = 2.4167 VDWAALS = -341.7512 EEL = -801614.2095 HBOND = 0.0000 1-4 VDW = 37.4290 1-4 EEL = 0.3277 RESTRAINT = 0.0000 ... RESTARTED DUE TO LINMIN FAILURE ... ***** REPEATED LINMIN FAILURE ***** ***** SEE http://ambermd.org/Questions/linmin.html FOR MORE INFO ***** 请问这是怎么回事呢？为什么会出现failure呢？ 我的input文件 如下： dhfrc1 nvt &cntrl ievb=1, imin=1, maxcyc=400, ntmin=1, ncyc=200, irest = 0, ntx=1, cut=12.0, ntpr = 1, ntave=1, ntwr = 1, ntwx = 1, ntwe = 1, ibelly=1, bellymask="@2614", / &ewald nfft1 = 120, nfft2 = 120, nfft3 = 120, / |
回复此楼» 猜你喜欢
什么是人一生最重要的？
已经有7人回复
-
版面费该交吗
已经有17人回复
-
体制内长辈说体制内绝大部分一辈子在底层，如同你们一样大部分普通教师忙且收入低
已经有19人回复
-
【博士招生】太原理工大学2026化工博士
已经有8人回复
-
280求调剂
已经有4人回复
-
面上可以超过30页吧？
已经有12人回复
-
为什么中国大学工科教授们水了那么多所谓的顶会顶刊，但还是做不出宇树机器人？
已经有11人回复
-
网上报道青年教师午睡中猝死、熬夜猝死的越来越多，主要哪些原因引起的？
已经有9人回复