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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » NH4+对接
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柯艳萍

铜虫 (初入文坛)

[求助] NH4+对接 已有1人参与

NH4+能用autodock进行对接吗？我从一蛋白质结构上截取出来的铵离子pdb文件只有一个N原子，作为配体输pdb入时出错。是pdb文件有问题还是其他原因啊？请大神赐教
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1楼 2014-05-02 10:51:41
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
柯艳萍: 金币+10, 谢谢啊，那应该用什么对接软件啊 2014-05-03 14:23:32
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2014-05-16 18:30:21
本帖内容被屏蔽
2楼2014-05-03 14:09:15
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柯艳萍

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-05-03 14:09:15
NH4+不建议用autodock系列的软件对接
试试其他的 对接软件
autodock软件会把配体的non-polar 氢原子去除

谢谢啊，那一般用什么软件对接啊
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3楼2014-05-22 21:52:14
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