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yyc12596

新虫 (著名写手)

[交流] 170kDa膜蛋白MRP1跑WB遇到问题 已有7人参与

需要做一个膜蛋白,MRP1,分子量170kDa.
       WB一直遇到问题,没有拿到自己的目的条带。
     
     使用了Thermo的膜蛋白提取试剂盒,细胞裂解和离心都是在冰上或者四度进行的。膜蛋白和胞浆蛋白在-20度冻存。

     因为膜蛋白100度煮沸5分钟据说会沉淀,所以样本解冻之后1:1加lamaelli(5%2-ME)loading buffer,37度温育30分钟,然后直接上样。BIO-RAD的4-15%的胶。
     之后恒压100V,湿转2小时。中间换一次冰盒。电流从0.3A会增高到0.45A.

        封闭,一抗,二抗,显影。
     标本用了人THP-1细胞株(未用PMA分化),以及人血来源的巨噬细胞(M-CSF分化)。

     一抗用了R&D的MRP1(QCRL,MAB19291),Abcam的MRP1(IU2H10,识别MRP1的1-33aa)。两支抗体孵育出的条带都在55kDa大小!
     下图是Abcam一抗孵育之后。
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yyc12596

新虫 (著名写手)

1% benzonase的作用:

Benzonase® endonuclease has been especially designed for applications in biotechnological processing, such as:
• removing DNA/RNA from proteins and other biologicals
• reducing viscosity caused by nucleic acids
• preparing samples in electrophoresis and chromatography
• preventing cell clumping

这一步可能是关键步骤吗?也许需要买一下这个酶,加到样本里去。
5楼2014-04-30 04:00:07
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yyc12596

新虫 (著名写手)

小木虫貌似上传图片很困难。那就不传图片了。反正现在的问题就是本该在170KDA处的条带一直没有,但是55KDA处每次都出现一条特异性条带。

   转膜用的是0.45um的PVDF膜。

    Abcam公司的抗体WB图,以及其他文献用的ENZO家的MRPr1抗体孵育出来的带都很漂亮,位置也对。

    原因何在?求经验!
2楼2014-04-30 03:43:06
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yyc12596

新虫 (著名写手)

文献上的方法:
Latency-Associated Degradation of the MRP1 Drug Transporter During Latent Human Cytomegalovirus Infection
Michael P. Weekes, Shireen Y. L. Tan, Emma Poole, Suzanne Talbot, Robin Antrobus, Duncan L. Smith, Christina Montag, Steven P. Gygi, John H. Sinclair, Paul J. Lehner*
*Corresponding author. E-mail pjl30@cam.ac.uk
Published 12 April 2013, Science 340, 199 (2013)

Primary antibodies used for immunoblotting were: MRPr1 α-MRP1 (Enzo Life Sciences)

Immunoblotting :
For immunoblots, cells were lysed in SDS sample buffer in TBS with 1% benzonase. Lysates were heated for 30 min at 37°C, separated by SDS/PAGE (UL138 -12% polyacrylamide gel; MRP1 - 7% polyacrylamide gel) and transferred to PVDF membranes (Millipore). For MRP1, membranes were denatured with 6M guanidinium chloride. Reactive bands were detected by SuperSignal West Pico or Dura substrates (Thermo).
3楼2014-04-30 03:46:21
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yyc12596

新虫 (著名写手)

现在怀疑目标蛋白是不是被降解了?55KDA的条带让人很不舒坦。
    上样:
    2x Laemmli Sample Buffer #161-0737

Dilute protein samples 1:1 in 2x Laemmli sample buffer before loading on SDS-PAGE gels (requires the addition of β-mercaptoethanol).
•Formulation: 65.8 mM Tris-HCl, pH 6.8, 2.1% SDS, 26.3% (w/v) glycerol, 0.01% bromophenol blue
4楼2014-04-30 03:51:57
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