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dnp荣誉版主 (知名作家)
小木虫浪子
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[交流]
[求助]蛋白质库搜索结果分析
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现在有一些蛋白质数据，通过Sequest算法对蛋白质库进行了搜索，输出结果如下(我只是截取了一段，参数省略，只有蛋白质匹配结果)： # Rank/Sp (M+H)+ deltCn XCorr Sp Ions --- ------- --------- ------ ------ ---- ---- 1. 1 / 36 2639.0678 0.0000 1.8826 294.8 21/100 2. 2 / 4 2638.0813 0.0195 1.8459 398.0 21/80 3. 3 / 49 2637.9159 0.0344 1.8179 281.8 19/92 4. 4 /138 2639.2609 0.1016 1.6914 238.3 18/96 5. 5 / 24 2637.9499 0.1404 1.6184 311.9 22/104 7. 7 / 1 2640.0289 0.1693 1.5638 463.1 22/88 ———————————————————————————————————————— # Reference Peptide --- --------- ------- 1. gi|1573992|gb|AAC22626.1| Q.AHSLGLKAVISSSIESSLGLSQLARI.A 2. gi|1572999|gb|AAC21730.1| S.KVLYDSFYKKYDWAKDVVQKI.N 3. SW:K1CJ_HUMAN E.ASLAETEGRYCVQLSQIQAQISAL.E 4. gi|1574079|gb|AAC22704.1| I.LALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSL.N 5. gi|1573748|gb|AAC22400.1| N.GGGQIVSPADKDIAALIDKVAAGNIQD.L 7. gi|1573037|gb|AAC21764.1| Q.VESVLYPNKGGMLSFRLQDEAWV.N 问题是： 请问Reference那一列中那些的代号代表什么，蛋白质代号么？应助的虫友将有5金币的酬谢，谢谢…… |
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3楼2008-03-09 23:59:38
taotao4108
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2楼2008-03-09 22:59:53
dnp
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