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caomeipai

新虫 (小有名气)

[求助] 求助有shelx 2013的虫友，帮助生成一下键长，键角及氢键列表，多谢！ 已有1人参与

有已修好的数据RES.和CIF.，其中CIF.中包含了HKL.。这个数据由于存在溶剂无序的问题，所以加了squeeze的指令，本人能力有限，老板是请了一个海外合作的老师帮忙的。尝试用原始文件，或者单独把HKL.拉出来进行处理，不管是使用shelx（老版），还是pwt都不能顺利精修或者生出列表。不知道是我使用的是shelx是以前的老版本，还是数据的原因。现在急需键长，键角和氢键的生成列表，希望坛子里面有shelx2013的，或者熟悉这方面的帮助一下，万分感谢！！！
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  • 附件 1 : cd_sq_(1).cif
    • 2014-04-27 00:20:39, 1.22 M
  • 附件 2 : cd_sq_(1).res
    • 2014-04-27 00:20:45, 10.5 K

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1楼 2014-04-27 00:23:56
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caomeipai

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by luxtal at 2014-04-27 05:34:53
搞定了，结果见附件。你操作不成功是因为cif文件结构变了，建议你升级ShelX。

目前看到的文件里面有了键长，键角，但是没有找到氢键列表，麻烦您帮助生成一下（D-H...A        d(D-H)              d(H...A)        d(D...A)        <DHA       
            O1W-H11...O2        0.8400        2.1800        2.6346        114.00）
这个我们一般是用pwt生成列表里最下面一行的。
我用diamond打开画图，这个应该是有氢键的，麻烦您在帮忙看一下！
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4楼2014-04-27 19:35:32
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
caomeipai: 金币+15, ★★★很有帮助, 氢键还请您看一下！ 2014-04-27 19:36:00
caomeipai: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-28 10:58:24
搞定了，结果见附件。你操作不成功是因为cif文件结构变了，建议你升级ShelX。
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  • 附件 1 : ok.rtf
    • 2014-04-26 17:45:40, 19.31 K
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
2楼2014-04-27 05:34:53
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)
顺带提醒一句，你们请的海外高手也一般般，连纽角都没生成，纯属应付你们！
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What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
3楼2014-04-27 05:36:28
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caomeipai

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by luxtal at 2014-04-27 05:36:28
顺带提醒一句，你们请的海外高手也一般般，连纽角都没生成，纯属应付你们！

这个老师还是蛮厉害的，只是我们老师不怎么样，很简单的问题有些也不会，我们跟在后面也都是自己摸索，所以~~~
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5楼2014-04-27 19:38:24
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