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至尊木虫 (著名写手)

One Piece

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专业: 林木遗传育种学

[求助] ISSR-PCR分析时每一种不同材料都得进行体系优化吗，到底和哪些因素有关？已有3人参与

求助各位大虾，最近看PCR体系建立和优化论文，产生了一些疑问：是不是每一种植物（材料）进行ISSR-PCR分析时的体系都不一样，即使同一科属的？如果是，那为什么会不一样，难道只是基因组DNA不一样造成的？是不是对同一材料，当使用不同引物时，可以用相同的体系，只是TM值改下就行了？希望不吝解答，谢谢！！

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有些东西因为得不到而变得美好，有些东西因为拥有而变得弥足珍贵！

1楼 2014-04-25 18:15:34

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gdmchql

金虫 (初入文坛)

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专业: 基因表达调控与表观遗传学

【答案】应助回帖

ISSR是一种基于PCR的分析技术，受到DNA模板、引物、酶用量以及退火温度，甚至实验室环境条件等因素的影响，因此一般来说不同物种都要建立和优化PCR体系。因为它们基因组序列不同。当然，优化的PCR体系也是相对稳定，对某个样品可能仍要适当调整
我当时在做的时候，对于同一样品，使用不同引物时，只是改变了引物的Tm值，其他因素都是基本相同的。