24小时热门版块排行榜    

查看: 4338  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

biostar2009

专家顾问 (正式写手)

[求助] 核苷酸质谱 已有1人参与

搞生物的,理化基础太差,问几个问题:
Nucleosides were separated by reverse phase ultra-performance liquid chromatography on a C18 column with online mass spectrometry detection using Agilent 6410 QQQ triple-quadruple LC mass spectrometer in positive electrospray ionization mode.
The nucleosides were quantified using the nucleoside to base ion mass transitions of  
282.1/ 150.1 (m6A), 268.1/136.1 (A), 244.1/112.1 (C), 284.1/152.1 (G), and 245.1/113.1 (U).
Quantification was performed by comparison with the standard curve obtained from pure nucleoside standards running at the same batch of samples. The ratio of m6A to A was calculated based on the calculated concentrations

这段话大概表面意思我懂,一些具体问题

1,反向HPLC是不是就可以把各种不同碱基的核苷酸分开?比如这里列的m6A,A,C,G,U?

2,positive electrospray ionization mode这是个什么意思,通俗易懂一点。

3,质谱对同分异构体怎么区分?比如m6A,和m1A。

4,是不是理论上质谱可以检测所有的未知物质?比如我的样品中,要是还有不是这5种的其他类型核苷酸,我能知道他是什么吗?

比如以下这些类型的分子:

核苷酸质谱
1.jpg


核苷酸质谱-1
2.jpg


核苷酸质谱-2
3.jpg


核苷酸质谱-3
4.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问

引用回帖:
4楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-04-25 14:39:00
核苷酸的结构贴上
质谱会把分子打碎这个我懂一点,
那么,m6A和m1A,比如,在HPLC中会有差异么?
还是说,m6A和m1A一起进入质谱仪,然后再打碎之后,从峰图判断是否存在同分异构体?

1.jpg

2.jpg
...

用EI给你举个简单的例子
核苷酸质谱-4
untitled.png

7楼2014-04-25 15:56:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
biostar2009: 金币+20, 有帮助, 迅速有效! 2014-04-25 14:32:13
biostar2009: 金币+50, ★★★很有帮助, 感谢热心帮助,理解中! 2014-04-26 19:13:16
positive electrospray ionization mode这是个什么意思,通俗易懂一点。
答:正离子模式,意思是使样品得到一个质子,带上正电荷,生成准分子离子
2楼2014-04-25 14:30:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问

【答案】应助回帖

质谱对同分异构体怎么区分?比如m6A,和m1A。
答:对于不同的结构会有不同的裂解方式,根据裂解方式来做以区分

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-04-25 14:31:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biostar2009

专家顾问 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wy19871124 at 2014-04-25 14:31:39
质谱对同分异构体怎么区分?比如m6A,和m1A。
答:对于不同的结构会有不同的裂解方式,根据裂解方式来做以区分

核苷酸的结构贴上
质谱会把分子打碎这个我懂一点,
那么,m6A和m1A,比如,在HPLC中会有差异么?
还是说,m6A和m1A一起进入质谱仪,然后再打碎之后,从峰图判断是否存在同分异构体?
核苷酸质谱-5
1.jpg


核苷酸质谱-6
2.jpg

4楼2014-04-25 14:39:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 好奇怪的filecode +3 布布和一二 2026-08-08 4/200 2026-08-08 17:46 by zhanghaozhu
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:22 by oEVWOejN9taj
[找工作] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:07 by oEVWOejN9taj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 15:59 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +5 布布和一二 2026-08-08 8/400 2026-08-08 14:54 by archvillain
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:47 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见