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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 质谱分析 » 核苷酸质谱
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

[求助] 核苷酸质谱 已有1人参与

搞生物的，理化基础太差，问几个问题：
Nucleosides were separated by reverse phase ultra-performance liquid chromatography on a C18 column with online mass spectrometry detection using Agilent 6410 QQQ triple-quadruple LC mass spectrometer in positive electrospray ionization mode.
The nucleosides were quantified using the nucleoside to base ion mass transitions of  
282.1/ 150.1 (m6A), 268.1/136.1 (A), 244.1/112.1 (C), 284.1/152.1 (G), and 245.1/113.1 (U).
Quantification was performed by comparison with the standard curve obtained from pure nucleoside standards running at the same batch of samples. The ratio of m6A to A was calculated based on the calculated concentrations

这段话大概表面意思我懂，一些具体问题

1，反向HPLC是不是就可以把各种不同碱基的核苷酸分开？比如这里列的m6A，A，C，G，U？

2，positive electrospray ionization mode这是个什么意思，通俗易懂一点。

3，质谱对同分异构体怎么区分？比如m6A，和m1A。

4，是不是理论上质谱可以检测所有的未知物质？比如我的样品中，要是还有不是这5种的其他类型核苷酸，我能知道他是什么吗？

比如以下这些类型的分子：

核苷酸质谱
1.jpg


核苷酸质谱-1
2.jpg


核苷酸质谱-2
3.jpg


核苷酸质谱-3
4.jpg
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1楼 2014-04-25 14:20:50
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佑安_90

金虫 (小有名气)
1，反向HPLC是不是就可以把各种不同碱基的核苷酸分开？比如这里列的m6A，A，C，G，U？
首先，你图上画的都是核苷不是核苷酸，所以你说的m6A，A，C，G，U一般是可以分开的，难度不大

2，positive electrospray ionization mode这是个什么意思，通俗易懂一点。
核苷作为碱性物质，一般在质谱中用正离子模式得到更好的离子化效率。

3，质谱对同分异构体怎么区分？比如m6A，和m1A。
m6A，和m1A虽然母离子一致，但是其核苷骨架结构不同，所以用MRM模式可以很容易分开。
4，是不是理论上质谱可以检测所有的未知物质？比如我的样品中，要是还有不是这5种的其他类型核苷酸，我能知道他是什么吗？
除非它不能离子化，一般是可以检测未知物质的，如果想看其它被检测出的核苷酸是什么，可以对样品进行高分辨检测，然后进行二级打碎，根据得到的母离子和子离子进行搜库，现在有专门针对修饰核苷的库，你可以看一下。
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trywhatyoucandoandbelieveinyouself
11楼2016-07-13 16:59:48
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wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问

【答案】应助回帖

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感谢参与，应助指数 +1
biostar2009: 金币+20, ★有帮助, 迅速有效！ 2014-04-25 14:32:13
biostar2009: 金币+50, ★★★很有帮助, 感谢热心帮助，理解中！ 2014-04-26 19:13:16
positive electrospray ionization mode这是个什么意思，通俗易懂一点。
答：正离子模式，意思是使样品得到一个质子，带上正电荷，生成准分子离子
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2楼2014-04-25 14:30:24
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wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问

【答案】应助回帖

质谱对同分异构体怎么区分？比如m6A，和m1A。
答：对于不同的结构会有不同的裂解方式，根据裂解方式来做以区分
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biostar2009
3楼2014-04-25 14:31:39
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wy19871124 at 2014-04-25 14:31:39
质谱对同分异构体怎么区分？比如m6A，和m1A。
答：对于不同的结构会有不同的裂解方式，根据裂解方式来做以区分

核苷酸的结构贴上
质谱会把分子打碎这个我懂一点，
那么，m6A和m1A，比如，在HPLC中会有差异么？
还是说，m6A和m1A一起进入质谱仪，然后再打碎之后，从峰图判断是否存在同分异构体？
核苷酸质谱-4
1.jpg


核苷酸质谱-5
2.jpg
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4楼2014-04-25 14:39:00
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