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【求助】请教分子力学与分子动力学的区别
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网上有人如下解释二者的区别,可还是不明白,分子力学的需不需要求解牛顿运动方程?在分子力学中分子的电子波函数需要求解不?分子动力学需要求解电子波函数不? 分子动力学模拟(Molecular dynamics simulation)简称为MD模拟,其基本模拟过程是在一定系综及已知分子位能函数的条件下,从计算分子间作用力着手,求解牛顿运动方程,得到体系中每个分子微观状态随时间的真正变化,再将粒子的位置和动量组成的微观状态对时间平均,即可求出体系的压力、能量、粘度等宏观性质以及组成粒子的空间分布等微观结构。该方法既可计算体系的平衡性质,也可计算体系的各种动力学性质。 分子力学是用计算机在原子水平上模拟给定分子模型的结构与性质,进而得到分子的各种物理性质与化学性质,如结构参数、振动频率、构象能量、相互作用能量、偶极矩、密度、摩尔体积、汽化焓等。用于复杂体系的计算,Force Field (力场): Amber CHARMM OPLS UFF [ Last edited by hufeng on 2008-3-7 at 20:12 ] |
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MD分子动力学 |
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7楼2008-03-20 13:49:43
huairpan
木虫 (正式写手)
很牛
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2楼2008-03-07 21:04:19
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢解答
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢解答
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计算机辅助药物设计应用计算机的计算功能来计算分子三维结构,所基于的理论计算大体有3种:量子化学,分子力学和分子动力学。 量子化学:应用量子力学的原理和方法研究分子的微观结构,是研究分子结构和性质的最重要的方法之一。 分子力学:又称为立场方法,是基于经典牛顿力学方程的一种计算分子的平衡结构和能量的方法。 分子动力学:是基于经典牛顿力学的又一种分子模拟方法。 量子化学和分子力学都用于研究分子结构,二者的主要区别在于:量子化学主要处理对象为电子,其运动服从量子力学规律;而分子力学是经验力场模型,以原子为质点,服从经典力学运动规律。 与分子力学不同,分子动力学求解的是随时间变化的分子的状态、行为和过程。 依据这些定义,可以解答你的问题:分子力学需要牛顿运动方程 分子力学和分子动力学均不需要求解电子的波函数。 |
3楼2008-03-07 21:20:18
4楼2008-03-08 17:07:51













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