24小时热门版块排行榜    

查看: 3477  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wdaobin

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 新手求助一个quantum-espresso的使用问题! 已有1人参与

我编写了一个Grephene结构优化的代码,quantum-espresso运行的时候没有提示错误,程序一直在运行但也没有任何输出,代码如下所示:
&CONTROL
calculation =’relax’,
restart_mode=’from_scratch’,
pseudo_dir = "/usr/share/espresso/pseudo",
outdir = "/home/wangdb/Workspaces/QE/graphene",
/
&SYSTEM
ibrav = 4,
celldm(1) = 4.64117D0,
celldm(3) = 12.2149837D0,
nat = 2,
ntyp = 1,
ecutwfc = 60,
occupations = "smearing",
smearing = ’fermi-dirac’,
degauss = 0.02,
/
&ELECTRONS
conv_thr = 1.D-8,
mixing_beta = 0.3D0,
/
&IONS
ion_dynamics = "bfgs",
pot_extrapolation = "atomic",
/
ATOMIC_SPECIES
C 12.0107 C.pbe-van_bm.UPF
ATOMIC_POSITIONS
C 0.0000000 0.0000000 0.000000
C 0.0000000 0.67735027 0.000000
K_POINTS automatic
30 30 1 1 1 1

后来又试着运行程序自带的例子,结果输出如下错误:
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 0.NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.You may or may not see output from other processes, depending onexactly when Open MPI kills them.

刚开始用QE,不知道如何处理,请大家帮忙,谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wdaobin

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by liqizuiyang at 2014-05-07 22:24:08
QE-5.0.2对应帮助文档中SYSTEM下没有do_ee和nelec这两个参数。

另外nelec这个参数看上去应该是整数。

另外“ATOMIC_SPECIES
N  1.00  N.pbe-paw_kj.UPF”
原子符号后面那个数字为相对原子质量,N接近于14.

谢谢您!我按照您的方法修改了一下,现在已经没有read namelist错误了。但是我使用了:
&IONS
ion_dynamics = "bfgs",
pot_extrapolation = "atomic",
以后,有报错了:
from bfgs : error #         1
      step_old is NOT normalized
把bfgs下的那些参数都定义了,也不管用,正在纠结中!
13楼2014-05-09 15:04:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wdaobin: 金币+3, 有帮助, 3Q 2014-05-05 11:50:42
wdaobin: 金币+2, 有帮助, 3Q 2014-05-05 11:51:27
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 0.NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
从这里来看是编译程序上的问题,mpi出现了问题,你可以先测试一下,用自带的例子。
2楼2014-04-22 00:25:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wdaobin

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-22 00:25:29
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 0.NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
从这里来看是编译程序上的问题,mpi出现了问题,你可以 ...

我是在Debian上用sudo直接安装的,后来装了个openmpi-bin,然后运行quantum-espresso自带的例子就出现如下错误:
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 0.NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.You may or may not see output from other processes, depending onexactly when Open MPI kills them.
3楼2014-04-22 22:23:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by wdaobin at 2014-04-22 22:23:04
我是在Debian上用sudo直接安装的,后来装了个openmpi-bin,然后运行quantum-espresso自带的例子就出现如下错误:
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 0.NOTE: invok ...

Debian? 那不如ubuntu了。也是debian的包。
这个肯定是安装的错误,这里无法给出确切的回答。情况复杂,需要你自己自己去看看安装说明,尤其是你的openmpi

你要程序并行,你必须先安装openmpi,然后用openmpi去编译pwscf.但是你先装了,然后mpi ,这肯定不行。从你信息中只能看出这点。
4楼2014-04-22 22:53:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:03 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:51 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:15 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:51 by 9i7PCSZyMzot
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:39 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:03 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:03 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-18 7/350 2026-09-19 21:03 by 9i7PCSZyMzot
[教师之家] 现代”学阀”该如何界定 +3 iaeyuan 2026-09-19 3/150 2026-09-19 20:52 by 没昵称呀
[基金申请] 国社科系统bug了,是不是要放榜了? +7 kynobel 2026-09-16 9/450 2026-09-19 14:52 by 接好运婷
[考博] 申博发邮件 +8 Lmengk 2026-09-15 9/450 2026-09-19 09:27 by 中间体超市
[有机交流] 各位大神,目前国内有哪些比较好用的逆合成软件? 20+3 zapen 2026-09-15 9/450 2026-09-18 18:17 by zapen
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组|2027级博士研究生招生公告 +7 水士口 2026-09-16 8/400 2026-09-16 13:47 by kkklens
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +8 两三岁ss 2026-09-14 8/400 2026-09-16 09:46 by 水士口
信息提示
请填处理意见