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小木虫于

金虫 (正式写手)

[求助] 计算phonopy 提示没安装python-lxml 已有1人参与

我安装了numpy lxml yaml phonopy
用phonopy --fc vasprun.xml时提示未安装python-lxml 可是我明明已经安装好了。python中import lxml是能正常导入这个模块的。不知道这是怎么回事?请大家帮我一下。
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gclai

木虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by 小木虫于 at 2014-04-21 10:31:22
用phonopy算声子谱,多长时间能算完?我以为很慢,像vasp一样,就在服务器上装的,如果很快,我就在笔记本上装了。...

笔记本就够用了,试试就知道了。
努力去做,做最好的。
13楼2014-04-21 10:46:56
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普通回帖

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2014-04-21 11:27:47
Phonopy 用的都是python下的库函数

numpy lxml 有通用包,还有python-numpy与python-lxml。删除以前安装的lxml,重新安装python-lxml即可。
2楼2014-04-20 18:04:00
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小木虫于

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-20 18:04:00
Phonopy 用的都是python下的库函数

numpy lxml 有通用包,还有python-numpy与python-lxml。删除以前安装的lxml,重新安装python-lxml即可。

我安装的就是python的这些模块啊。在python交互式界面中, import lxml ,import numpy 都是可以正常导入的。
你的意思是说还有叫做python-numpy  pytyhon-lxml,而不是叫做numpy 和lxml的名字的库么?我在网上找到的都是numpy lxml 而找不到python-numpy 和python-lxml啊。在哪里能找的到啊,多谢。
3楼2014-04-20 18:42:21
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gclai

木虫 (小有名气)

ubuntu系统的话,直接命令:sudo get-apt  install python-lxml 就行了。
努力去做,做最好的。
4楼2014-04-20 19:06:58
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小木虫于

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gclai at 2014-04-20 19:06:58
ubuntu系统的话,直接命令:sudo get-apt  install python-lxml 就行了。

不是,我是在超级计算中心上,用的是centos,没有root权限,是在自己的账户下安装的。我都是下载的安装包安装的。numpy lxml yaml phonopy都能正常安装,phonopy命令也能用,就是在phononpy --fc vasprun.xml时 提示you neet to install python-lxml。
5楼2014-04-20 19:26:57
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小木虫于

金虫 (正式写手)

另外,机器上原来的是python2.4 我从新安装了python2.7 然后都是用python2.7安装的。已经保证用的python就是python2.7,而且安装的这些python模块嗾使安装在python2.7的site-packages目录下的,这个目录已经在pythonpath变量下了
6楼2014-04-20 19:29:20
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 小木虫于 at 2014-04-20 18:42:21
我安装的就是python的这些模块啊。在python交互式界面中, import lxml ,import numpy 都是可以正常导入的。
你的意思是说还有叫做python-numpy  pytyhon-lxml,而不是叫做numpy 和lxml的名字的库么?我在网上找 ...

redhat,FC,centos等系统在root权限下:
yum install  python-lxml
7楼2014-04-20 20:25:35
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
小木虫于: 金币+3, 有帮助 2014-04-21 11:28:28
python2.7下游easy_install,用这个直接安装
easy_install python-numpy
8楼2014-04-20 20:26:42
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小木虫于

金虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-20 20:26:42
python2.7下游easy_install,用这个直接安装
easy_install python-numpy

现在有几条限制,机器不能联网,没有root权限。这个easy_install 是否要求联网?
9楼2014-04-20 20:53:03
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by 小木虫于 at 2014-04-20 20:53:03
现在有几条限制,机器不能联网,没有root权限。这个easy_install 是否要求联网?...

不能联网这些都是徒劳,那你自己下载压缩包安装吧
10楼2014-04-20 22:51:09
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