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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 计算phonopy 提示没安装python-lxml
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小木虫于

金虫 (正式写手)

[求助] 计算phonopy 提示没安装python-lxml 已有1人参与

我安装了numpy lxml yaml phonopy
用phonopy --fc vasprun.xml时提示未安装python-lxml 可是我明明已经安装好了。python中import lxml是能正常导入这个模块的。不知道这是怎么回事？请大家帮我一下。
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1楼 2014-04-20 16:39:08
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

gclai

木虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 小木虫于 at 2014-04-21 10:31:22
用phonopy算声子谱，多长时间能算完？我以为很慢，像vasp一样，就在服务器上装的，如果很快，我就在笔记本上装了。...

笔记本就够用了，试试就知道了。
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努力去做，做最好的。
13楼2014-04-21 10:46:56
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普通回帖

mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小木虫于: 金币+2, ★有帮助 2014-04-21 11:27:47
Phonopy 用的都是python下的库函数

numpy lxml 有通用包，还有python-numpy与python-lxml。删除以前安装的lxml,重新安装python-lxml即可。
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2楼2014-04-20 18:04:00
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小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-20 18:04:00
Phonopy 用的都是python下的库函数

numpy lxml 有通用包，还有python-numpy与python-lxml。删除以前安装的lxml,重新安装python-lxml即可。

我安装的就是python的这些模块啊。在python交互式界面中， import lxml ，import numpy 都是可以正常导入的。
你的意思是说还有叫做python-numpy  pytyhon-lxml，而不是叫做numpy 和lxml的名字的库么？我在网上找到的都是numpy lxml 而找不到python-numpy 和python-lxml啊。在哪里能找的到啊，多谢。
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3楼2014-04-20 18:42:21
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gclai

木虫 (小有名气)
ubuntu系统的话，直接命令：sudo get-apt  install python-lxml 就行了。
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努力去做，做最好的。
4楼2014-04-20 19:06:58
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小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gclai at 2014-04-20 19:06:58
ubuntu系统的话，直接命令：sudo get-apt  install python-lxml 就行了。

不是，我是在超级计算中心上，用的是centos，没有root权限，是在自己的账户下安装的。我都是下载的安装包安装的。numpy lxml yaml phonopy都能正常安装，phonopy命令也能用，就是在phononpy --fc vasprun.xml时 提示you neet to install python-lxml。
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5楼2014-04-20 19:26:57
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小木虫于

金虫 (正式写手)
另外，机器上原来的是python2.4 我从新安装了python2.7 然后都是用python2.7安装的。已经保证用的python就是python2.7，而且安装的这些python模块嗾使安装在python2.7的site-packages目录下的，这个目录已经在pythonpath变量下了
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6楼2014-04-20 19:29:20
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小木虫于 at 2014-04-20 18:42:21
我安装的就是python的这些模块啊。在python交互式界面中， import lxml ，import numpy 都是可以正常导入的。
你的意思是说还有叫做python-numpy  pytyhon-lxml，而不是叫做numpy 和lxml的名字的库么？我在网上找 ...

redhat,FC,centos等系统在root权限下：
yum install  python-lxml
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7楼2014-04-20 20:25:35
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小木虫于: 金币+3, ★有帮助 2014-04-21 11:28:28
python2.7下游easy_install,用这个直接安装
easy_install python-numpy
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8楼2014-04-20 20:26:42
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小木虫于

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-20 20:26:42
python2.7下游easy_install,用这个直接安装
easy_install python-numpy

现在有几条限制，机器不能联网，没有root权限。这个easy_install 是否要求联网？
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9楼2014-04-20 20:53:03
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 小木虫于 at 2014-04-20 20:53:03
现在有几条限制，机器不能联网，没有root权限。这个easy_install 是否要求联网？...

不能联网这些都是徒劳，那你自己下载压缩包安装吧
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10楼2014-04-20 22:51:09
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