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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 压力控制选择
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staventchoke

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 压力控制选择

请问MS模拟高手，对于分子动力学计算中压力的控制方法，forcite模块中提供了berendsen，andersen与parrinello三种方法，MS教程中强调在晶格中的应用，andersen与berendsen适用于晶格尺寸大小，不适用于形状改变，andersen应用于液体。文献中报道采用berendsen控制压力变化，一般而言，（无规）聚合物理论上讲属于液体，理应为andersen，这是怎么回事?  
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1楼 2014-04-20 16:17:22
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徐豆汁

木虫 (著名写手)
★
staventchoke(金币+1): 谢谢参与
加油
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10楼2014-04-20 17:18:36
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-04-22 20:08:57
如果只是平衡态性质的话，三个应该差不多，但如果涉及动力学性质的话, Andersen会有些问题，因为里面用了随机力。Berendsen的优点是平衡起来快，Parrinello不太了解，应该跟Nose-Hoover Thermostat原理有些类似，但可能比Berendsen慢一点吧。
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12楼2014-04-21 00:58:34
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cxjzly20082楼
2014-04-20 16:22   回复  
staventchoke(金币+1): 谢谢参与
tuzihxy3楼
2014-04-20 16:30   回复  
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kiss200855374楼
2014-04-20 16:31   回复  
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卡欣5楼
2014-04-20 16:47   回复  
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tzynew6楼
2014-04-20 16:49   回复  
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tylgd20117楼
2014-04-20 16:53   回复  
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Happy丘丘8楼
2014-04-20 17:01   回复  
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henry8359楼
2014-04-20 17:13   回复  
staventchoke(金币+1): 谢谢参与
明月清泉111楼
2014-04-20 17:49   回复  
staventchoke(金币+1): 谢谢参与
！ [ 发自小木虫客户端 ]
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