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staventchoke

铁杆木虫 (著名写手)


[交流] 压力控制选择

请问MS模拟高手,对于分子动力学计算中压力的控制方法,forcite模块中提供了berendsen,andersen与parrinello三种方法,MS教程中强调在晶格中的应用,andersen与berendsen适用于晶格尺寸大小,不适用于形状改变,andersen应用于液体。文献中报道采用berendsen控制压力变化,一般而言,(无规)聚合物理论上讲属于液体,理应为andersen,这是怎么回事?  
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徐豆汁

木虫 (著名写手)


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加油
10楼2014-04-20 17:18:36
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★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-04-22 20:08:57
如果只是平衡态性质的话,三个应该差不多,但如果涉及动力学性质的话, Andersen会有些问题,因为里面用了随机力。Berendsen的优点是平衡起来快,Parrinello不太了解,应该跟Nose-Hoover Thermostat原理有些类似,但可能比Berendsen慢一点吧。
12楼2014-04-21 00:58:34
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简单回复
2014-04-20 16:22   回复  
staventchoke(金币+1): 谢谢参与
tuzihxy3楼
2014-04-20 16:30   回复  
staventchoke(金币+1): 谢谢参与
2014-04-20 16:31   回复  
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卡欣5楼
2014-04-20 16:47   回复  
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tzynew6楼
2014-04-20 16:49   回复  
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tylgd20117楼
2014-04-20 16:53   回复  
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2014-04-20 17:01   回复  
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henry8359楼
2014-04-20 17:13   回复  
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2014-04-20 17:49   回复  
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