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jixiangtian115

铁虫 (小有名气)

[交流] 向高手请教两个问题

1如何确定配合物中一定存在氢键?是否是通过相关文件.
2如何确定配合物中一定存在π-π作用?如果是通过用diamond作图,用到那些操作?
        谢谢了!!!!!!!!

[ Last edited by jixiangtian115 on 2008-3-5 at 14:57 ]
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lilywang501

金虫 (小有名气)

在结构解析时,在.ins文件中,键入htab命令,在进行XL计算,然后在.lst文件中就会列出可能出现的氢键,把这些氢键列在.ins文件中,然后计算,在.cif就会出现最终的氢键啦。
在diamond可以看出π-π作用,先找出有π作用的两个平面,然后从其中一个平面上找出一点向另一个平面作垂线,即可知道两个平面的大概距离,若在3A左右,基本上就有作用啦
2楼2008-03-05 17:54:03
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biyanfeng

铜虫 (著名写手)

楼上的说法有道理,但是这样的找的作用,特别是π-π作用有点主观。
推荐使用PLATON软件
在软件中打开CIF RES 或者INS(推荐使用修改好的CIF),然后 PUB---CAL ALL 将得到LIS文件,最后有个目录,所有的弱作用都在。
氢键都是给列出来的(包括分子内和分子间的),稍微编辑一下就能发表用。
至于π-π作用给出面到面,心到心,边到面的信息,还有C-H。。π作用,所以最终要的需要根据不同的情况判断
PLATON软件是免费的
论坛上很多资源
3楼2008-03-06 09:45:12
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jixiangtian115

铁虫 (小有名气)

请楼主从我中扣金币

请楼主从我中扣10个金币给两个lilywang501   biyanfeng

好心人
4楼2008-03-07 08:43:11
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