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空蓝Y劫

新虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 12.5
散金: 9
帖子: 57
在线: 22.8小时
虫号: 1346434
注册: 2011-07-15
专业: 食品科学基础

[求助] 求菌种鉴定方法详述已有9人参与

药厂环境菌及工艺用水捡出的各类菌，需要鉴定种类，具体品种。现求菌种鉴定的各类方法，优缺点，适用范围，以及相应的仪器设备大体成本等，越详细越好。求大神帮忙。

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1楼 2014-04-17 21:49:12

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liuboeo

新虫 (小有名气)

应助: 12 (小学生)
金币: 1091.3
帖子: 161
在线: 55小时
虫号: 2390057
注册: 2013-03-31
性别: GG
专业: 微生物生理与生物化学

【答案】应助回帖

细菌菌种鉴定比较可靠的是分子方法，主要是测16S rRNA 基因序列，首先将细菌纯培养出来，提出DNA（试剂盒或者酚氯仿法，也可以不提DNA，直接微波或水煮，chelex去杂质），PCR一般用27F和1492R这对引物，生工都有卖的，也可以自己下订单合成，将测出的结果修剪后在NCBI里的BLAST里比对搜索，会有相似度由高到低的结果排序，想进一步确定菌株归属可以构建进化树，选取相似度最高的模式菌株16S数据构建。