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herosmzd

银虫 (正式写手)

[交流] [求助] 关于轨道能量的组成

我想计算一个分子的轨道能量组成,就是HUMO和LUMO都由什么原子的哪个轨道组成.我的输入是
# b3lyp/6-311g(d,p) pop=(nbo,savemixed) geom=connectivity volume polar

但是看不懂输出文件
哪位高手帮解答一下,或者教教我怎么算,看哪个部分,说的具体点,万分感谢
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红枫叶688

木虫 (小有名气)

真是太感谢大家了,我读了这些东西学到了好多知识哦!
9楼2008-06-05 15:33:27
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K372

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
herosmzd(金币+3,VIP+0):谢谢解答,请问这里显示的是每个轨道的组成成分百分比吗?这是我想知道的
herosmzd(金币+3,VIP+0):谢谢解答,请问这里显示的是每个轨道的组成成分百分比吗?这是我想知道的
herosmzd(金币+3,VIP+0):谢谢解答,请问这里显示的是每个轨道的组成成分百分比吗?这是我想知道的
lei0736(金币+2,VIP+0):多谢解答
lei0736(金币+0,VIP+0):十大“耐思”版主评选欢迎参与投票 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
你可以尝试改用pop=full关键字,在结果信息里会有:
Molecular Orbital Coefficients
在这下面就是分子轨道的系数信息,占据轨道后面有(O)标注,空轨道后面有(V)标注,找到最后一个(O)和第一个(V)就是HOMO和LUMO,例如:

                           6         7         8         9        10
                        (AG)--O  (B3G)--O  (B3U)--O   (AG)--V  (B1U)--V
     EIGENVALUES --    -0.58804  -0.50849  -0.37684   0.04798   0.05997
   1 1   C  1S          0.00595   0.00000   0.00000  -0.01055  -0.01100
   2        2S          0.01024   0.00000   0.00000  -0.01716  -0.01882
   3        2PX         0.00000   0.00000   0.16316   0.00000   0.00000

例子是乙烯,这里检查8和9就可以了

也可以用GaussView打开查看
2楼2008-03-05 10:59:15
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K372

银虫 (小有名气)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):多谢持续关注
对不起刚才出去了一下,下面继续简述用GaussView查看轨道的方法
用GaussView的时候,打开chk文件,选择Results菜单下面的Surface
先在第一个下拉菜单中选择轨道,再用第二个下拉菜单绘出图形,比较直观
但是要注意,如果选择的基组比较复杂,极化函数、弥散函数较多,有可能在HOMO和LUMO之间出现“虚轨道”,这时需要根据化学常识判断,把虚轨道剔除,找出正确的LUMO(所有占据轨道都不会出现图样错误的虚轨道)
若在64位机器上生成的chk文件在32位机器上无法打开,可以先转换成fchk文件
3楼2008-03-05 11:14:34
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K372

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
herosmzd(金币+1,VIP+0):谢谢
lei0736(金币+2,VIP+0):多谢建议
不是百分比,而是一个轨道系数,轨道系数的平方值代表了原子轨道对分子轨道的贡献,平方值大的原子轨道在这个分子轨道里所贡献的比例比较大。
对于这个系数我也觉得很奇怪,因为它居然不是归一化的!如果你要获得百分比,建议你将所关注的分子轨道所有的系数平方和求出,用每一个原子轨道的系数平方除以求得的平方和,所得的数值可以大致反映出该原子轨道在分子轨道中贡献的百分比。
以上为愚人拙见,仅供参考,敬请高手点评!

[ Last edited by K372 on 2008-3-5 at 11:23 ]
4楼2008-03-05 11:19:05
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