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[求助] 关于轨道能量的组成
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我想计算一个分子的轨道能量组成,就是HUMO和LUMO都由什么原子的哪个轨道组成.我的输入是 # b3lyp/6-311g(d,p) pop=(nbo,savemixed) geom=connectivity volume polar 但是看不懂输出文件 哪位高手帮解答一下,或者教教我怎么算,看哪个部分,说的具体点,万分感谢 |
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lei0736(金币+2,VIP+0):多谢建议
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不是百分比，而是一个轨道系数，轨道系数的平方值代表了原子轨道对分子轨道的贡献，平方值大的原子轨道在这个分子轨道里所贡献的比例比较大。 对于这个系数我也觉得很奇怪，因为它居然不是归一化的！如果你要获得百分比，建议你将所关注的分子轨道所有的系数平方和求出，用每一个原子轨道的系数平方除以求得的平方和，所得的数值可以大致反映出该原子轨道在分子轨道中贡献的百分比。 以上为愚人拙见，仅供参考，敬请高手点评！ [ Last edited by K372 on 2008-3-5 at 11:23 ] |
4楼2008-03-05 11:19:05
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herosmzd(金币+3,VIP+0):谢谢解答,请问这里显示的是每个轨道的组成成分百分比吗?这是我想知道的
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你可以尝试改用pop=full关键字，在结果信息里会有： Molecular Orbital Coefficients 在这下面就是分子轨道的系数信息，占据轨道后面有(O)标注，空轨道后面有(V)标注，找到最后一个(O)和第一个(V)就是HOMO和LUMO，例如： 6 7 8 9 10 (AG)--O (B3G)--O (B3U)--O (AG)--V (B1U)--V EIGENVALUES -- -0.58804 -0.50849 -0.37684 0.04798 0.05997 1 1 C 1S 0.00595 0.00000 0.00000 -0.01055 -0.01100 2 2S 0.01024 0.00000 0.00000 -0.01716 -0.01882 3 2PX 0.00000 0.00000 0.16316 0.00000 0.00000 例子是乙烯，这里检查8和9就可以了 也可以用GaussView打开查看 |
2楼2008-03-05 10:59:15
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lei0736(金币+2,VIP+0):多谢持续关注
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对不起刚才出去了一下，下面继续简述用GaussView查看轨道的方法 用GaussView的时候，打开chk文件，选择Results菜单下面的Surface 先在第一个下拉菜单中选择轨道，再用第二个下拉菜单绘出图形，比较直观 但是要注意，如果选择的基组比较复杂，极化函数、弥散函数较多，有可能在HOMO和LUMO之间出现“虚轨道”，这时需要根据化学常识判断，把虚轨道剔除，找出正确的LUMO（所有占据轨道都不会出现图样错误的虚轨道） 若在64位机器上生成的chk文件在32位机器上无法打开，可以先转换成fchk文件 |
3楼2008-03-05 11:14:34
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lei0736(金币+2,VIP+0):多谢
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不用客气！但是还有一点需要提醒LZ注意的： 请注意您所选择基组的劈裂性！ 我们在做轨道分析的时候，宁可选择STO-3G这样的基组，不要小看STO-3G！很多情况下只有它能够给出完全可信的结果！比如使用6-31+G(d)，由于价层轨道是由2组STO组成，且加入了一组高主量子数的弥散函数和一组高角动量的极化函数（由于6-31G基组对极化函数的定义，其中还额外含有一个相当于高主量子数的弥散函数），使得各个重原子的价轨道组成非常复杂！比如C2S、C3S、C4S、C5S可能都来源于真实碳原子的2S轨道！这就给我们判断分子轨道组成带来了很大的困难。 而STO-KG基组虽然计算能量的时候变分性不如价劈裂基组好，但在进行分子轨道分析的时候不会出现上述问题。 |
5楼2008-03-05 12:26:40