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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 求助几个B级错误
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xianhuiduo

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 求助几个B级错误

如下：
PLAT415_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-X       H16A   ..  H1WE    ..       2.08 Ang.
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H2WA   ..  H9WA    ..       1.85 Ang.
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H2WB   ..  H5WA    ..       2.03 Ang.
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H3WB   ..  H6WA    ..       2.07 Ang.
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H6WB   ..  H1WE    ..       1.50 Ang.
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H6WB   ..  H1WF    ..       1.56 Ang.
错误相同。
谢谢大家的帮助！！！
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1楼 2008-03-04 19:06:40
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crystalsnet

新虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
xianhuiduo(金币+5,VIP+0):谢谢，那如何加氢比较合适呀，有11个水。
氢加的有问题
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2楼2008-03-04 23:05:31
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xianhuiduo

至尊木虫 (职业作家)
谢谢crystalsnet，有11个水，好不容易才修改到现在这个样子，没有A类错误了，怕一换又会产生新的错误。
请教大家产生这种错误的原因是什么，加氢时采用什么样的规则能避免这种错误。
多谢，多谢！！！
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3楼2008-03-05 08:13:44
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crystalsnet

新虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
xianhuiduo(金币+5,VIP+0):是一个配合物，有11个游离水，怎么进行理论上的预算呀，请多赐教，呵呵！
是水簇吧
我有一个，也很难加的
我曾向人请教，预先可以进行理论上的预算
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4楼2008-03-05 08:21:41
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xianhuiduo

至尊木虫 (职业作家)
是一个配合物，有11个游离水，那怎么进行理论上的预算呀！
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5楼2008-03-05 10:42:23
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chemeuro

银虫 (正式写手)
★
xianhuiduo(金币+1,VIP+0):不投 Acta 只是想知道这个问题怎么解决，谢谢你的建议！！！
如果不是投acta的话,就没什么问题
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6楼2008-03-05 10:55:25
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lilywang501

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
xianhuiduo(金币+5,VIP+0):谢谢，试过这种方法，还是不行！！！
可以用理论加氢的方法把所有水上的氢加上，限定O-H距离为0.82，应该就不会出现这个错误了
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7楼2008-03-05 17:41:50
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xianhuiduo

至尊木虫 (职业作家)
谢谢，试过这种方法，还是不行！！！
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8楼2008-03-06 12:56:05
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haohan316

金虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xianhuiduo(金币+10,VIP+0):谢谢解答,不知有什么解决的办法没有!
你的晶体数据O。。。O之间的键长偏差是多少？如果很大的话，你的水漂移太大，可能审稿编辑会不认可，晶体中的H加起来本身是意义不大的，不过为了发表，你可以测试低温数据。另外，H...H之间的距离大于2的都可以接受，但是如果小于1.8，可能你的加氢是错误的，没有问题的，如果结构很好，可以解释或让编辑帮助解决。
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9楼2008-03-08 18:32:04
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xianhuiduo

至尊木虫 (职业作家)
氢键信息:
            D-H...A                      d(D-H)      d(H...A)    d(D...A)    <(DHA)
  
O(1W)-H(1WB)...O(6)          0.870(19)   1.97(3)     2.811(5)    161(7)
O(1W)-H(1WA)...O(4)          0.857(19)   2.03(3)     2.862(5)    163(6)
O(2W)-H(2WA)...O(9W)#4       0.84(2)     2.02(4)     2.811(7)    158(8)
O(2W)-H(2WB)...O(5W)         0.85(2)     2.05(5)     2.842(8)    154(9)
O(3W)-H(3WA)...O(3)#5        0.85(2)     2.08(4)     2.860(6)    151(8)
O(3W)-H(3WB)...O(2W)         0.87(2)     2.10(3)     2.957(8)    165(9)
O(4W)-H(4WA)...O(3)          0.86(2)     1.89(2)     2.751(6)    175(7)
O(4W)-H(4WB)...O(2W)#6       0.85(2)     2.00(3)     2.822(7)    161(6)
O(5W)-H(5WA)...O(5W)#4       0.84(2)     2.45(10)    2.924(14)   116(9)
O(5W)-H(5WB)...O(1W)         0.85(2)     2.47(8)     2.901(8)    113(7)
O(6W)-H(6WA)...O(3W)#2       0.88(2)     1.98(4)     2.812(7)    157(8)
O(6W)-H(6WB)...O(11W)#7      0.88(2)     1.93(4)     2.757(7)    158(9)
O(7W)-H(7WA)...O(4)          0.848(19)   1.99(2)     2.834(6)    176(7)
O(7W)-H(7WB)...O(2)          0.831(19)   1.77(2)     2.592(6)    170(7)
O(8W)-H(8WA)...O(6)          0.818(19)   2.040(19)   2.853(6)    172(6)
O(8W)-H(8WB)...O(5)#8        0.847(19)   1.95(3)     2.760(5)    161(6)
O(9W)-H(9WA)...O(6)          0.838(19)   2.56(7)     2.805(5)    98(5)
O(9W)-H(9WB)...O(4)          0.853(19)   2.11(4)     2.873(5)    148(6)
O(10W)-H(1WC)...O(8W)        0.829(19)   2.06(5)     2.694(6)    133(6)
O(10W)-H(1WD)...O(2)#9       0.83(2)     2.34(4)     3.041(6)    142(6)
O(11W)-H(1WE)...O(6W)#10     0.86(2)     2.19(11)    2.757(7)    124(10)
O(11W)-H(1WF)...O(5)         0.86(2)     2.40(12)    2.636(7)    96(8)
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10楼2008-03-08 21:42:29
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