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yanlili

金虫 (正式写手)


[求助] 关于DNase 已有2人参与

最近用到DNase I来去除DNA, 在网上查到需要加辅酶Ca, Mg离子,结果发现加了以后经常会出现沉淀,我认为是原液里有CO3离子的原因,产生了碳酸钙,但是这样把我溶液中的一些蛋白质也吸走了,这是我不希望的。有个同学说她们以前用DNaSE好像没有加这些离子,所以我想问到底需不需要加?有不需要加的话是什么酶,哪个公司的。
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

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yanlili(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-04-14 10:29:41
yanlili: 金币+6, ★★★★★最佳答案 2014-04-14 10:31:28
最初来自牛胰腺的DNaseI((E.C.3.1.21.1),是高度Mg2+和Ca2+依赖的,各种公司的产品都是这样。

一些公司出过改良版,现在最有名的应该是invitrogen的TubroDNase,从这个酶的产品说明看,通过改良DNaseI的催化中心,提高了对DNA的亲和力(Km),同时提高了DNaseI对一价盐离子的抵抗力。

但是其实也只字未提二价离子依赖性的问题。不过,因为TubroDNase活力较传统酶极大提高,我现在在一些体系下就直接加酶不加buffer,体系中也没有太多二价离子。

工具酶中还可以切DNA的,只剩下S1 nuclease和Micrococcal Nuclease,严格说来这两个酶并不区分RNA和DNA,并且一个依赖Zn2+,一个依赖Ca2+。
2楼2014-04-13 19:31:25
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Neo2000

木虫 (著名写手)

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yanlili(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-04-14 10:29:56
引用回帖:
2楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-04-13 19:31:25
最初来自牛胰腺的DNaseI((E.C.3.1.21.1),是高度Mg2+和Ca2+依赖的,各种公司的产品都是这样。

一些公司出过改良版,现在最有名的应该是invitrogen的TubroDNase,从这个酶的产品说明看,通过改良DNaseI的催化中 ...

fermentas的产品就挺好,buffer里面已经加了,和普通酶切一样操作,不用考虑那么多,RNA提的纯一点就好

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-04-13 19:42:04
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-04-13 19:42:04
fermentas的产品就挺好,buffer里面已经加了,和普通酶切一样操作,不用考虑那么多,RNA提的纯一点就好
...

楼主现在好像不是为了除RNA中污染的DNA。。。
4楼2014-04-13 20:00:05
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