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结肠和脾脏提取RNA有不同吗?
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我用同样的方法提取小鼠结肠和脾脏的RNA,作RT-PCR,脾脏结果蛮好,都能跑出内参action,就是结肠老是出不来结果,请教各位高手结肠和脾脏提取RNA的注意要点有不同吗?? 已经重复好多遍了,结肠老是没有内参条带出来。 我的抽提方法是用trizol法 组织取出后马上放入液氮中,后-70保存,提取时加液氮将标本碾碎,加trizol1ml碾磨,装入EP管后加200ul氯仿,离心,12000,4度, 15分种,取上清,再加氯仿重复上述步骤一遍(怕提取的东西不纯);在吸出的上清中加异丙醇(1:1)冰上静置10分钟左右,离心:12000,4度, 10分钟,有白色沉淀在管底,用75%乙醇(DEPC水配)洗,使沉淀悬浮管中,后再离心12000,4度,10分钟,将乙醇倒去,尽量用Tip头吸取残存的乙醇,加DEPC水10~20ul溶解后行RT,用的是试剂盒,再将RT的cDNA跑内参,但是脾脏都有条带,结肠基本上都没有,我的标本的取材,保存,提取等都是同时,同条件的,(只是结肠加了一步用灭菌冰盐水快速清洗肠内容物)。都快崩溃了,是不是肠道的RNA更容易降解啊?还是我的步骤中有什么不妥的地方?请各位高手帮帮忙啊!!! 还有由于我们实验室的某种原因,不能测OD值,而且看琼脂糖电泳结果的仪器也坏了,真是无语啊:( 我都只能PCR后跑PAGE胶看结果,所以很郁闷 |
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