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大兔齐齐

新虫 (初入文坛)

[求助] 生物信息学下一代测序方向求助!!!!!紧急求助!!! 已有2人参与

我是做生物信息学中的下一代测序(NGS)方向的,我现在下载了一个纯的tumor(癌症)样本,和其对应的normal样本,是bam格式的,我把它转成SAM格式了,然后要按一定比例混合,这样混合后的数据来做仿真,混合的C程序写不出来,求助啊!!!!
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努力!
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ltscu

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


用C做是自虐倾向的才会干的。

你可以用许多方法随机抽样,最简单的用python一句话搞定:
newSample=sample(zip(tumor,normal)) #一比一抽样,tumor,normal是样本的list,别管那个bam,sam格式,都是些文本记录而已。
3楼2014-04-26 13:51:08
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笨笨的书虫

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
刚开始研究这个,希望能多和楼主交流。

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-04-10 13:40:58
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