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新虫 (初入文坛)

[求助] 生物信息学下一代测序方向求助！！！！！紧急求助！！！已有2人参与

我是做生物信息学中的下一代测序（NGS）方向的，我现在下载了一个纯的tumor（癌症）样本，和其对应的normal样本，是bam格式的，我把它转成SAM格式了，然后要按一定比例混合，这样混合后的数据来做仿真，混合的C程序写不出来，求助啊！！！！

努力！

1楼 2014-04-09 20:27:04

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新虫 (小有名气)

感谢参与，应助指数 +1

刚开始研究这个，希望能多和楼主交流。

[ 发自小木虫客户端 ]

2楼2014-04-10 13:40:58

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铜虫 (正式写手)

用C做是自虐倾向的才会干的。

你可以用许多方法随机抽样，最简单的用python一句话搞定：
newSample=sample(zip(tumor,normal)) #一比一抽样，tumor,normal是样本的list，别管那个bam,sam格式，都是些文本记录而已。

3楼2014-04-26 13:51:08

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