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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » NF3的内坐标表示
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candy雅雅04

金虫 (小有名气)

[求助] NF3的内坐标表示 已有2人参与

求（NF3）A+在高斯中的Z坐标表示，其中A+可为H+，Li+，Na+，K+。
   有么有相关的网站可以查找分子的坐标表示？
   谢谢！！！！！
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努力做自己喜欢的事.........
1楼 2014-04-07 21:40:17
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huaiji

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2014-04-08 02:43:32
在高斯中的Z坐标（或内坐标）表示可以再用GaussView中构建好后保存任务输入文件时，去掉使用笛卡尔坐标前的勾保存，就会使用内坐标表示。
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真正的人生,只有在经过艰难卓绝的斗争之后才能实现;心灵纯洁的人,生活充满甜蜜和喜悦.
2楼2014-04-07 21:49:39
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huaiji

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

若能找到GaussView可识别的相关分子结构文件格式文件，也可按照如上方法操作。如晶体的晶型结构信息文件.cif格式文件。……
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真正的人生,只有在经过艰难卓绝的斗争之后才能实现;心灵纯洁的人,生活充满甜蜜和喜悦.
3楼2014-04-07 21:53:20
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youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2014-04-08 02:43:42
分子内坐标的书写要对所写结构有一定了解，NF3应该是C3v点群可以照着NH3进行书写（在N的顶端设置一个虚原子构成Td点群）
x
N 1 1.
F  2 r1 1 c1
F  2 r1  1

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平生多磨砺，男儿自横行！
4楼2014-04-08 01:40:08
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youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by youyno at 2014-04-08 01:40:08
分子内坐标的书写要对所写结构有一定了解，NF3应该是C3v点群可以照着NH3进行书写（在N的顶端设置一个虚原子构成Td点群）
x
N 1 1.
F  2 r1 1 c1
F  2 r1  1

x
n 1 1.
f  2 r  1 c1
f  2 r  1 c1 3  c2
f  2 r  1 c1 3  -c2

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平生多磨砺，男儿自横行！
5楼2014-04-08 01:44:49
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youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by youyno at 2014-04-08 01:44:49
x
n 1 1.
f  2 r  1 c1
f  2 r  1 c1 3  c2
f  2 r  1 c1 3  -c2
...

如果A离子参与配位，应该在顶端将虚原子用A代替并加入另一个键长变量即可

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平生多磨砺，男儿自横行！
6楼2014-04-08 01:48:55
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