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linda19918

银虫 (小有名气)

[求助] 进行VASP计算,怎么运行侯老师例子里面的脚本啊,一运行就出错!! 已有3人参与

#! /bin/sh
rm WAVECAR -rf
for i in 3.80 3.85 3.90 3.95 4.00 4.05 4.10 4.15 4.20 4.25 4.30
do
cat >POSCAR <<!
Al_fcc
$i
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
1
Direct
0.0 0.0 0.0
!
echo "a =$i angstrom";time vasp
E='grep "TOTEN" OUTCAR |tail -1|awk '{printf "%12.6f \n",$5}''
V='grep "volume" OUTCAR |tail -1|awk '{printf "%12.4f \n",$5}''
echo $V  $E >>EtVo.dat
echo $i  $E >>SUMMARY
done


以上是脚本内容,脚本的名字为run_a0.sh
运行脚本我也不知道用什么命令,
qsub        
chmod
   ./
    sh
以上命令都用过,均报错: line 21: syntax error: unexpected end of file
但是明明这个脚本只有20行啊~~
已经折腾了好几天了,我用的是SSH,是linux系统
还有我是用的qsub run_vasp.pbs 提交任务进行一般的vasp计算
本来是想用脚本进行参数优化的,我该怎么办!!!
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不做伸手党

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

把time vasp 中的time删掉就可以了
4楼2014-07-21 09:52:19
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查看全部 4 个回答

lzlgcdc

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-04-07 22:00:05
如果是windows下弄过的脚本在linux下运行会出错  会有不一样的地方   需要用命令修改的    你查一下试试
2楼2014-04-06 19:51:26
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mazuju028

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你确定time vasp是你集群上运行VASP的命令,如果不是,修改过来就可以了
锐气藏于胸,和气浮于脸,才气见于事,义气施与人
3楼2014-04-08 08:26:08
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