24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 203  |  回复: 2
当前主题已经存档。
【悬赏金币】回答本帖问题,作者science2008将赠送您 10 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

science2008

木虫 (正式写手)

[求助] 已知蛋白质一级结构,推测二级,三级结构的软件 有那些?

已知蛋白质一级结构,推测二级,三级结构的软件 有那些?

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

power5111

金虫 (正式写手)

3楼2008-02-28 10:54:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

zyzll2008

至尊木虫 (文坛精英)

快乐虫

蛋白质结构预测寻找某种蛋白质的空间结构,首先应该查询蛋白质数据库 HPDB 或 PDB,即查询是否已经有人做过该蛋白质的空间结构测定。 HPDB 或 PDB 中只存储至今人们已知其空间结构的蛋白质,数量占生物体中存在的各种蛋白质的很小部分。由于资金和技术等方面的问题,人们尚不知道许多蛋白质的空间结构。 对于这些蛋白质,结构预测是获得其空间结构的很好办法。

       如果已经拥有蛋白质一级结构序列,无论是由蛋白质测序仪直接测定得到氨基酸序列,或是由基因序列通过遗传密码翻译推测得到氨基酸序列,都可以利用蛋白质结构预测软件(服务)对该蛋白质的三维结构进行预测。 尽管预测本身有一定风险,但总比一无所知要好得多。蛋白质结构预测技术已经取得了很大进步,每种预测方法都是根据特定的规则进行合理的预测 ,具有一定的可信度。

       目前预测蛋白质结构的方法可分为三大类:

       同源建模——目标序列与模板序列比较,按照模板序列的空间结构,经过优化,产生目标序列三维结构;
 
       折叠识别——预测二级结构,预测折叠方式,参考其它蛋白的空间结构,产生目标序列三维结构;
 
       从无到有——单个氨基酸形成二级结构的倾向,加上各种作用力力场信息,直接产生目标序列三维结构。
同源建模方法目前被认为是最精确的方法。同源性大于50%时,结果比较可靠;30~50%之间, 其结果需要参考其它蛋白的信息。同源性小于30%时,人们一般采用折叠识别方法。同源性更小时,从无到有法更有效。

       希望上述内容对你有帮助!
→条条大路通罗马←
2楼2008-02-28 08:49:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂推荐 +7 小聂爱学习 2026-04-14 7/350 2026-04-16 00:19 by cuisz
[考研] 初试324 中药学 一志愿天中医 求调剂 +3 李的Lucky 2026-04-10 3/150 2026-04-15 23:54 by 陈皮皮
[考研] 急需调剂 +5 绝不放弃22 2026-04-15 5/250 2026-04-15 23:11 by Tide man
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +9 lzmk 2026-04-14 10/500 2026-04-15 20:02 by 学员JpLReM
[考研] 0854调剂 +13 长弓傲 2026-04-12 16/800 2026-04-15 13:45 by fenglj492
[考研] 272分材料子求调剂 +41 Loy0361 2026-04-10 54/2700 2026-04-14 18:00 by lhj2009
[考研] 材料专业344求调剂 +17 hualkop 2026-04-10 22/1100 2026-04-14 16:21 by sxdj2
[考研] 各位老师好,求调剂,本科211,一志愿天津大学生物与医药学硕,差两名录取。 +11 路六六jjj 2026-04-13 11/550 2026-04-14 16:01 by zs92450
[基金申请] RY:中国产出的科学垃圾论文,绝对数量和比例都世界第一 +6 zju2000 2026-04-14 17/850 2026-04-14 14:34 by jurkat.1640
[考研] 人工智能320调剂08工类还有机会吗 +18 振—TZ 2026-04-10 19/950 2026-04-14 10:34 by screening
[考研] B区0809 ,数一英一,290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 0831一轮调剂失败求助 +10 小熊睿睿_s 2026-04-11 10/500 2026-04-12 22:43 by 长弓傲
[考研] 0831生医工第一轮调剂失败求助 +12 小熊睿睿_s 2026-04-11 16/800 2026-04-12 16:28 by 钰璞
[考研] 085410 273求调剂 +10 X1999 2026-04-09 10/500 2026-04-12 09:24 by 逆水乘风
[找工作] 山东高校教师考核超级无底线,员工过不下去啦 +4 qut2026 2026-04-09 9/450 2026-04-12 00:54 by qut2026
[考研] 283求调剂 086004考英二数二 +17 那个噜子 2026-04-10 18/900 2026-04-11 16:27 by 明月此时有
[考研] 求调剂 +6 archer.. 2026-04-09 8/400 2026-04-11 10:55 by zhq0425
[考研] 初试261 +3 Asht少 2026-04-10 6/300 2026-04-10 16:38 by Asht少
[考研] 292求调剂 +9 笑笑袁 2026-04-09 9/450 2026-04-10 10:05 by LHGeng
信息提示
请填处理意见