| 查看: 205 | 回复: 2 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者science2008将赠送您 10 个金币 | |||
science2008木虫 (正式写手)
|
[求助]
已知蛋白质一级结构，推测二级，三级结构的软件 有那些？
|
||
| 已知蛋白质一级结构，推测二级，三级结构的软件 有那些？ |
回复此楼» 猜你喜欢
急需调剂
已经有8人回复
-
申博/考博
已经有4人回复
-
化工学硕294分，求导师收留
已经有37人回复
-
求调剂
已经有11人回复
-
260求调剂
已经有4人回复
-
一志愿华中农业071010，320求调剂
已经有19人回复
-
304求调剂
已经有7人回复
-
求博导｜生物质基多孔碳/超级电容方向，已有相关成果，寻能源材料/碳材料方向老师
已经有3人回复
-
二苯甲酮酸类衍生物
已经有6人回复
-
接受任何调剂
已经有4人回复
zyzll2008
至尊木虫 (文坛精英)
快乐虫
- 应助: 43 (小学生)
- 金币: 35066.3
- 散金: 150
- 红花: 10
- 沙发: 90
- 帖子: 12148
- 在线: 31491.4小时
- 虫号: 502735
- 注册: 2008-02-14
- 专业: 计算机软件
|
蛋白质结构预测寻找某种蛋白质的空间结构，首先应该查询蛋白质数据库 HPDB 或 PDB，即查询是否已经有人做过该蛋白质的空间结构测定。 HPDB 或 PDB 中只存储至今人们已知其空间结构的蛋白质，数量占生物体中存在的各种蛋白质的很小部分。由于资金和技术等方面的问题，人们尚不知道许多蛋白质的空间结构。 对于这些蛋白质，结构预测是获得其空间结构的很好办法。 如果已经拥有蛋白质一级结构序列，无论是由蛋白质测序仪直接测定得到氨基酸序列，或是由基因序列通过遗传密码翻译推测得到氨基酸序列，都可以利用蛋白质结构预测软件（服务）对该蛋白质的三维结构进行预测。 尽管预测本身有一定风险，但总比一无所知要好得多。蛋白质结构预测技术已经取得了很大进步，每种预测方法都是根据特定的规则进行合理的预测 ，具有一定的可信度。 目前预测蛋白质结构的方法可分为三大类： 同源建模——目标序列与模板序列比较，按照模板序列的空间结构，经过优化，产生目标序列三维结构； 折叠识别——预测二级结构，预测折叠方式，参考其它蛋白的空间结构，产生目标序列三维结构； 从无到有——单个氨基酸形成二级结构的倾向，加上各种作用力力场信息，直接产生目标序列三维结构。 同源建模方法目前被认为是最精确的方法。同源性大于50％时，结果比较可靠；30～50％之间， 其结果需要参考其它蛋白的信息。同源性小于30％时，人们一般采用折叠识别方法。同源性更小时，从无到有法更有效。 希望上述内容对你有帮助！ |
2楼2008-02-28 08:49:30
3楼2008-02-28 10:54:15
50