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小幂狐

银虫 (小有名气)

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[求助] 外行求问，两种群间作用的Lotka-Volterra参数如何确定？悬赏中~ 已有3人参与

就是我做了2个微生物的共同培养生长曲线，这两种微生物是在低密度下互惠，高密度下竞争的。现在已知这个生长曲线，怎么求Lotka-Volterra模型中的那些a11，a12这类影响参数啊？外行不懂，诚心求教详细过程~
或者给我推荐论文或者课件~~~谢过了~

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1楼 2014-04-02 17:16:07

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diatom7890

木虫 (正式写手)

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专业: 群落生态学

【答案】应助回帖

qyang@tcd.ie
直接发邮件给我吧。

我自己的研究中涉及到过类似的东西：
我是只有一条曲线（bray-curtis distance）,在某个位置时间点之前曲线首先符合指数函数，然后到这个点后突然变为直线函数关系。所以我的问题相当于：我有一组数据，independent为时间，dependent为我的distance,我要通过对这组数据进行拟合来求得这条指数曲线和这条直线的参数（我要求得y=a1*e^b1x+c1中的a1,b1,c1.然后我还要求得直线y=a2x+b2中的a2和b2,当然还有这个未知的分割点t0）.当然对于这两条曲线你可以给定无穷的参数值，这时就可以通过最小二乘法等求得一个最佳的a,b,c,t的组合。

相关操作：先在R里面自定义一个函数，这个函数的值可以为总方差减去拟合模型所能解释的方差，然后用函数nlminb()来对你自己定义的这个函数进行最优化，这样就可以得到自定义函数的参数的估计值。