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ella0602

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于核磁共振做尿液代谢组学试验方法的问题已有1人参与

由于刚接触这个,所以问题比较多,我的试验方案是这样的,但是有几个疑惑,希望得到解答,方案如下:
进行核磁共振采集信号前,将尿液样品于室温下解冻,每个样品取400ul,加入200ull磷酸缓冲液(pH7.4,0.2M NaH2PO4/0.8 M Na2HPO4),质量分数10%重水(D2O,锁场),质量分数0.05%TSP(内标)。静置10min,再于13000g离心10min,取上清测试。
1.关于所用的PBS,我们常用的都是(pH7.4,0.2M NaH2PO4/0.2 M Na2HPO4)这样的比例配的,这个方案中用的Na2HPO4是0.8 M,这样的一个浓度设定有没有什么意义?如果我还是用(pH7.4,0.2M NaH2PO4/0.2 M Na2HPO4)这样的配制方法会不会出来的结果跟师兄的有差别?另外,可不可以直接买市售的那种固体缓冲剂直接溶解了使用?
老师说因为样品都是水溶液,所以压水峰比较难,那如果这样的话我用重水来配制缓冲液可不可行?压水峰会不会容易些?
2.实验方案中提到的:质量分数10%重水(D2O,锁场),质量分数0.05%TSP(内标),这里的质量分数我不是很明白,指的是占最后溶液总体积的质量分数吗?而且重水是液体一般应该用体积分数吧?方案里的PBS是用重水还是纯水配制的?
我在其他文献上看到有这种方法:尿样取400ul,加入200ul含0.05%TSP的重水配制的磷酸缓冲液,这个方案的PBS是用重水配置的,不知道跟上面那个有什么不同?
3.内标用TSP和DSS有什么不同?我看国外的文献中做尿液的内标大部分用的都是TSP。
3.低温冷冻离心这一步是不是必须的?有没有其他可替代的方法?
希望得到专业解答,多谢!
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ella0602

新虫 (初入文坛)

没人知道吗?
2楼2014-04-01 11:04:40
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Juno11

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

关于液体核磁压水峰的问题,不知你们用的是哪种方法。用wet序列可以对水峰有很好的压制了。
如果用重水完全来代替纯水也是完全可以的,但是一方面代价比较高,重水比较贵,另外你要考虑
你需要采集的信号中有没有严重的氢交换,因为如果发生化学交换,可能信号损失,而且会失去定量意义。因为重水不产生核磁信号。
关于其他样品制备方面,我也不太懂了。呵呵,我是做方法的。
3楼2014-04-19 15:05:22
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changchunwan

木虫 (小有名气)

您好,我跟您有相同的问题,您的问题解决了吗
4楼2017-11-27 15:54:28
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匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
5楼2018-03-02 16:55:04
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匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
6楼2018-03-02 16:56:08
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