24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1041  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

terry_well

荣誉版主 (知名作家)

笑熬浆糊——满脑浆糊

优秀版主优秀版主

[求助] 构建超级晶胞后运行不了,提示两步之间能量差过大 已有2人参与

各位前辈,
        我是新手,最近在做几种气体如CH2O在聚合物中的扩散模拟。比如我构建了PIB高分子+DOS塑化剂+CH2O的三元体系(分子数之比为4/6/8),各个分子结构如附图所示。每个分子都Minimizer了。构建晶胞后再次Minimizer。运行的是508K+0.001GPa下的NPT系综(NVE和NVT都试过不行)。不知道问题出在哪里?请高手指一条明路。谢谢!

构建超级晶胞后运行不了,提示两步之间能量差过大
CH2O.jpg
构建超级晶胞后运行不了,提示两步之间能量差过大-1
DOS.jpg
构建超级晶胞后运行不了,提示两步之间能量差过大-2
Polyisobutene.jpg
构建超级晶胞后运行不了,提示两步之间能量差过大-3
PIB-DOS-CH2O.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

签名:英文名“Terry”,EC版专用;中文名“浆糊哥”,灌水专用,谢谢合作!
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
terry_well: 金币+5, 有帮助 2014-03-31 00:56:24
discover more设置汇把 最大能量差设置得大一些,比如50,000或者100,000
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
5楼2014-03-30 16:48:38
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

smutao

禁虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
terry_well: 金币+5, ★★★很有帮助, 请再次帮忙 2014-03-30 16:08:49
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-31 17:04:41
本帖内容被屏蔽

2楼2014-03-30 13:15:43
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

terry_well

荣誉版主 (知名作家)

笑熬浆糊——满脑浆糊

优秀版主优秀版主

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-03-30 06:15:43
试试先固定体系的一部分
再做minimization

谢谢,请问具体怎么选择固定的部分呢?只是部分原子不动还是部分官能团或者分子不动?
签名:英文名“Terry”,EC版专用;中文名“浆糊哥”,灌水专用,谢谢合作!
3楼2014-03-30 16:08:26
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

terry_well

荣誉版主 (知名作家)

笑熬浆糊——满脑浆糊

优秀版主优秀版主

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-03-30 06:15:43
试试先固定体系的一部分
再做minimization

刚才试了,把整个DOS分子固定都不行。但是如果只构建PIB和CH2O按照10:8的比例,运行就没有问题(试了500ps)。
签名:英文名“Terry”,EC版专用;中文名“浆糊哥”,灌水专用,谢谢合作!
4楼2014-03-30 16:44:15
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 数一英一271专硕(085401)求调剂,可跨 +3 前行必有光 2026-03-28 4/200 2026-03-28 10:07 by laoshidan
[考研] 0703化学求调剂 +7 奶油草莓. 2026-03-22 8/400 2026-03-28 09:59 by 神马都不懂
[考研] 食品工程专硕一志愿中海洋309求调剂 +3 小张zxy张 2026-03-26 5/250 2026-03-27 18:42 by 小张zxy张
[考研] 考研调剂 +4 Sanmu-124 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:49 by kiokin
[考研] 考研化学308分求调剂 +10 你好明天你好 2026-03-23 12/600 2026-03-27 14:43 by shangxh
[考研] 317求调剂 +5 十闲wx 2026-03-24 5/250 2026-03-27 13:48 by 杨杨杨紫
[考研] 一志愿211,335分,0856,求调剂院校和导师 +4 倾____萧 2026-03-27 5/250 2026-03-27 11:52 by zhshch
[考研] 求调剂 +3 刘柯@ 2026-03-24 4/200 2026-03-27 11:28 by shangxh
[考研] 333求调剂 +6 wfh030413@ 2026-03-23 6/300 2026-03-26 22:45 by 学员8dgXkO
[考研] 总分322求生物学/生化与分子/生物信息学相关调剂 +5 星沉uu 2026-03-26 6/300 2026-03-26 19:02 by macy2011
[考研] 289求调剂 +17 硕星赴 2026-03-23 17/850 2026-03-26 16:18 by 不吃魚的貓
[考研] 总分293求调剂 +6 加一一九 2026-03-25 8/400 2026-03-26 13:30 by yujianx
[考研] 299求调剂 +4 15188958825 2026-03-25 4/200 2026-03-25 22:56 by 418490947
[考研] 290分调剂求助 +3 吉祥止止陈 2026-03-25 3/150 2026-03-25 19:58 by barlinike
[考研] 277分求调剂,跨调材料 +3 考研调剂lxh 2026-03-24 3/150 2026-03-24 13:52 by JourneyLucky
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
[考研] 070300,一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见