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[求助]
【求助】用chemdraw计算DNA的molecular dynamics的结果显示碱基都在外端合理吗？
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如题，小虫我最近尝试用chemdraw计算DNA的molecular dynamics，结果显示碱基都在外端，而磷酸骨架都在内部，这样的结果合理吗？ 由于小虫我不是做计算的，不懂这些东西，都是软件自动算的，只知道把温度确定为300K, step=2.0fs, frame=10 ,terminate afte=10000 step, heating/cooling rate=1.0 cal/atom/p. 另外，DNA的序列为5‘-CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCC-3'. 请高手看看这个结果是不是合理，具体的计算结构如附件所示。 还请懂行的前辈们帮帮忙，不胜感激！  CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCC-dynamics.jpg |
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