| 查看: 9318 | 回复: 21 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
seamas_gao1银虫 (小有名气)
|
[求助]
转录组测序结果的“raw data”和“clean data”里为什么全是100bp的序列？ 已有3人参与
|
|
| 我测了几个转录组样品，测序公司把“raw data”和“clean data”，都给我了，都是fq格式的文件，每个大概5个G。我打开发现里面全都是100 bp的序列，请问这正常吗？QC和拼接都是用这些100bp的序列吗？ |
回复此楼» 猜你喜欢
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有56人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
-
RO4929097 解析：双苯并氮杂䓬骨架与 Notch 通路实验设计要点
已经有0人回复
-
分子量 1157 的 PROTAC 怎么配不析出：SGK3-PROTAC1 的溶解、分装与图谱复核
已经有0人回复
-
logP 6.1 的羧酸怎么配母液：GSK 650394 的溶解窗口与稀释顺序
已经有0人回复
-
从"水不溶"到 71 mg/mL：雷特格韦的 pH 依赖溶解与螯合色谱边界
已经有0人回复
-
133 Ų 的极性表面积，如何决定 TNG462 的母液配制与色谱条件
已经有0人回复
seamas_gao1
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1617.5
- 散金: 15
- 帖子: 192
- 在线: 29.9小时
- 虫号: 1879385
- 注册: 2012-07-05
- 专业: 水产养殖学
18楼2014-04-15 07:48:09
3楼2014-03-31 12:09:23
seamas_gao1
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1617.5
- 散金: 15
- 帖子: 192
- 在线: 29.9小时
- 虫号: 1879385
- 注册: 2012-07-05
- 专业: 水产养殖学
4楼2014-04-01 08:00:38
【答案】应助回帖
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
seamas_gao1(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励热心回帖交流 2014-04-01 13:18:40
seamas_gao1: 金币+5, ★★★很有帮助, 十分感谢 2014-04-14 08:44:58
seamas_gao1(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励热心回帖交流 2014-04-01 13:18:40
seamas_gao1: 金币+5, ★★★很有帮助, 十分感谢 2014-04-14 08:44:58
|
正常的，如果是转录组、DNA重测序，illumina平台一般都是采用PE100测序，测序的过程中都是测DNA片断2端各100bp，所以下机出来的都是100bp的片断。 raw data是原始下机数据，clean data是经过过滤处理后留下的数据，该数据用于后续的生物信息分析。 |
5楼2014-04-01 10:58:42
