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zh7096457

金虫 (小有名气)

[求助] 关于酞菁钴的计算已有2人参与

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C
C                  1              B1
C                  2              B2    1              A1
N                  3              B3    2              A2    1              D1
C                  4              B4    3              A3    2              D2
C                  5              B5    4              A4    3              D3
C                  6              B6    5              A5    4              D4
C                  7              B7    6              A6    5              D5
N                  8              B8    7              A7    6              D6
C                  9              B9    8              A8    7              D7
N                  8             B10    7              A9    6              D8
C                 10             B11    9             A10    8              D9
C                 12             B12   10             A11    9             D10
C                 13             B13   12             A12   10             D11
N                 14             B14   13             A13   12             D12
C                 15             B15   14             A14   13             D13
N                 14             B16   13             A15   12             D14
C                  3             B17    2             A16    1             D15
C                 18             B18    3             A17    2             D16
C                 19             B19   18             A18    3             D17
N                 20             B20   19             A19   18             D18
C                 21             B21   20             A20   19             D19
N                 22             B22   21             A21   20             D20
N                 16             B23   15             A22   14             D21
C                 12             B24   10             A23    9             D22
C                 25             B25   12             A24   10             D23
C                 26             B26   25             A25   12             D24
C                 27             B27   26             A26   25             D25
C                  6             B28    5             A27    4             D26
C                 29             B29    6             A28    5             D27
C                 30             B30   29             A29    6             D28
C                  7             B31    6             A30    5             D29
C                 18             B32    3             A31    2             D30
C                 33             B33   18             A32    3             D31
C                 34             B34   33             A33   18             D32
C                 19             B35   18             A34    3             D33
C                  1             B36    2             A35    3             D34
C                 37             B37    1             A36    2             D35
C                 38             B38   37             A37    1             D36
C                  2             B39    1             A38   37             D37
O                 26             B40   25             A39   12             D38
C                 41             B41   26             A40   25             D39
C                 42             B42   41             A41   26             D40
C                 43             B43   42             A42   41             D41
C                 44             B44   43             A43   42             D42
C                 45             B45   44             A44   43             D43
C                 42             B46   41             A45   26             D44
C                 45             B47   44             A46   43             D45
C                 48             B48   45             A47   44             D46
C                 49             B49   48             A48   45             D47
O                 46             B50   45             A49   44             D48
O                 50             B51   49             A50   48             D49
C                 48             B52   45             A51   44             D50
H                 25             B53   12             A52   10             D51
H                 27             B54   26             A53   25             D52
H                 28             B55   27             A54   26             D53
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H                 32             B57    7             A56    6             D55
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H                 36             B59   19             A58   18             D57
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H                 47             B64   42             A63   41             D62
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H                 53             B66   48             A65   45             D64
H                 53             B67   48             A66   45             D65
H                 53             B68   48             A67   45             D66
C                 34             B69   33             A68   18             D67
C                 35             B70   34             A69   33             D68
O                 70             B71   34             A70   33             D69
O                 71             B72   35             A71   34             D70
O                 70             B73   34             A72   33             D71
H                 74             B74   70             A73   34             D72
O                 71             B75   35             A74   34             D73
H                 76             B76   71             A75   35             D74
C                 38             B77   37             A76    1             D75
O                 78             B78   38             A77   37             D76
O                 78             B79   38             A78   37             D77
H                 80             B80   78             A79   38             D78
C                 39             B81   38             A80   37             D79
O                 82             B82   39             A81   38             D80
O                 82             B83   39             A82   38             D81
H                 84             B84   82             A83   39             D82
C                 31             B85   30             A84   29             D83
O                 86             B86   31             A85   30             D84
O                 86             B87   31             A86   30             D85
H                 88             B88   86             A87   31             D86
C                 30             B89   29             A88    6             D87
O                 90             B90   30             A89   29             D88
O                 90             B91   30             A90   29             D89
H                 92             B92   90             A91   30             D90
Co                15             B93   14             A92   13             D91

   B1             1.41191575
   B2             1.46187457
   B3             1.37165436
   B4             1.37078235
   B5             4.65994929
   B6             1.41145278
   B7             1.46308428
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   B10            1.33052463
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   A8           110.45090673
   A9           124.34306539
   A10           96.56615424
   A11           41.25787039
   A12          106.68014116
   A13          108.33586688
   A14          110.15337978
   A15          124.21717421
   A16          140.96714212
   A17          124.17447654
   A18          106.71961653
   A19          108.12886044
   A20          110.43469299
   A21          127.60563568
   A22          127.63132018
   A23          162.72030431
   A24          117.16683685
   A25          121.92810411
   A26          120.43049349
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   A28          118.67940498
   A29          120.40902899
   A30          120.84598148
   A31          114.99891106
   A32          118.67134657
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   A34          120.88542016
   A35          120.85739355
   A36          118.66186728
   A37          120.44155142
   A38          120.85634412
   A39          116.82692062
   A40          121.48230352
   A41          115.69778778
   A42          119.48069363
   A43          121.52664267
   A44          117.40177451
   A45          123.37720315
   A46          124.53757214
   A47          118.62140658
   A48          123.26790903
   A49          121.84560327
   A50          126.48179257
   A51          120.21432093
   A52          122.22439911
   A53          119.11790705
   A54          120.98359094
   A55          121.51674545
   A56          121.51498282
   A57          121.50245348
   A58          121.52110824
   A59          121.52249265
   A60          121.51167814
   A61          118.92255359
   A62          119.04891873
   A63          122.16689809
   A64          121.75060016
   A65          110.97502426
   A66          111.11568730
   A67          111.14783184
   A68          115.38935424
   A69          124.12784698
   A70          124.29791519
   A71          124.27911577
   A72          112.67106935
   A73          105.97164988
   A74          112.76386505
   A75          105.99255316
   A76          115.40121880
   A77          124.29486311
   A78          112.71557984
   A79          105.96635712
   A80          124.05594433
   A81          124.29168984
   A82          112.69885083
   A83          105.96948759
   A84          124.06407916
   A85          124.27567365
   A86          112.69438195
   A87          105.95321132
   A88          115.35354121
   A89          124.24287708
   A90          112.76301561
   A91          106.02137864
   A92          124.98019220
   D1             0.06544093
   D2            -0.00482831
   D3           179.77162936
   D4          -180.00000000
   D5            -0.14402024
   D6            -0.07275470
   D7             0.04524591
   D8           179.77896494
   D9           179.94693018
   D10          179.78169634
   D11            0.01570925
   D12           -0.00975515
   D13            0.03526416
   D14          179.96461021
   D15         -179.89802785
   D16          179.94189135
   D17            0.09455689
   D18           -0.03339696
   D19            0.00000000
   D20         -179.89633537
   D21          179.94054068
   D22          178.66878617
   D23            1.18151233
   D24            0.28505669
   D25           -0.68692302
   D26          179.02424660
   D27            0.80057813
   D28            2.13943237
   D29          179.22861560
   D30            0.55203160
   D31          179.39669098
   D32            2.25713537
   D33          179.47490634
   D34         -179.49841739
   D35            0.01223709
   D36           -2.17875745
   D37            1.07973606
   D38          175.74873534
   D39          132.62507418
   D40          157.71288833
   D41          177.37482115
   D42            0.27751116
   D43           -0.40638598
   D44          -25.23249559
   D45          179.74355852
   D46          179.74556489
   D47           -0.05829820
   D48         -179.66893165
   D49         -179.93600076
   D50           -0.19336633
   D51         -179.02421746
   D52          178.97234471
   D53          179.91929668
   D54         -177.93320234
   D55         -178.76973857
   D56            0.69638221
   D57         -178.66252735
   D58          178.75373669
   D59          178.77448175
   D60           -2.50079558
   D61         -179.99522128
   D62            2.07709034
   D63          179.99560970
   D64         -179.88413176
   D65           59.73318789
   D66          -59.45443104
   D67         -174.15153478
   D68          172.64276108
   D69          -36.69607326
   D70          148.37056972
   D71          138.64239750
   D72         -179.42664145
   D73          -36.27845460
   D74         -179.55541834
   D75          174.24183196
   D76           35.99875143
   D77         -139.38732337
   D78          179.52886662
   D79         -172.81856266
   D80         -147.13032410
   D81           37.50330886
   D82          179.51076603
   D83          172.82884616
   D84          146.98603565
   D85          -37.66725496
   D86         -179.53005288
   D87         -174.30185716
   D88          -35.61066441
   D89          139.77869739
   D90         -179.46418903
   D91         -179.77372741

C H O N 0
6-31g(d)
****
Co 0
lanl2dz
****

Co 0
lanl2dz


上面是计算酞菁钴的文件，但是它的自旋多重度是2，这个事怎么回事呢？
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1楼2014-03-26 13:59:05
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gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh7096457: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-03-26 20:58:12
Co中d轨道电子未全部占满，根据化合价不一样，有各种自旋态，如果是Co2+，那么就是有2或者4两种自旋态，在酞菁中Co和四个氮配位，属于中强场，所以Co保持低自旋态，即自旋为2. 不确定的话，你也可以改成4再计算下，确定到底哪个为基态。
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2楼2014-03-26 20:25:41
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zh7096457

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gmy1990 at 2014-03-26 20:25:41
Co中d轨道电子未全部占满，根据化合价不一样，有各种自旋态，如果是Co2+，那么就是有2或者4两种自旋态，在酞菁中Co和四个氮配位，属于中强场，所以Co保持低自旋态，即自旋为2. 不确定的话，你也可以改成4再计算下， ...

谢谢啊，这个自旋应该就是2，不过我的输入文件有问题吗？还是我选的基组和方法有问题？
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3楼2014-03-26 20:57:37
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youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

方法和基组的写法不是应该如b3lyp/6-31g，有赝势的话b3lyp/genecp或者b3lyp/gen pseudo=read的格式吗？如果运行出错应该会有报错指明那里出错啊！
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平生多磨砺，男儿自横行！
4楼2014-03-26 21:02:25
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zh7096457

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gmy1990 at 2014-03-26 20:25:41
Co中d轨道电子未全部占满，根据化合价不一样，有各种自旋态，如果是Co2+，那么就是有2或者4两种自旋态，在酞菁中Co和四个氮配位，属于中强场，所以Co保持低自旋态，即自旋为2. 不确定的话，你也可以改成4再计算下， ...

那那个Fe和Cu自旋应该多少呢？Fe1？Cu2？
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5楼2014-03-26 21:06:18
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zh7096457

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by youyno at 2014-03-26 21:02:25
方法和基组的写法不是应该如b3lyp/6-31g，有赝势的话b3lyp/genecp或者b3lyp/gen pseudo=read的格式吗？如果运行出错应该会有报错指明那里出错啊！

运行没有出错，只是觉得这个自旋不太确定
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6楼2014-03-26 21:07:30
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youyno

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zh7096457 at 2014-03-26 21:07:30
运行没有出错，只是觉得这个自旋不太确定...

这应该就是你要解决问题的关键点，这么大的分子想要一下子弄清楚它的成键各方面的性质比较困难，除非有文献报道过，这是你自己的事啊！
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平生多磨砺，男儿自横行！
7楼2014-03-26 21:13:27
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gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
# opt b3lyp  gen
就行了
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8楼2014-03-26 21:13:59
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zh7096457

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by gmy1990 at 2014-03-26 21:13:59
# opt b3lyp  gen
就行了

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7174065&fpage=1这个关于酞菁铁的计算你可以帮我看看嘛？
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9楼2014-03-26 21:16:33
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ptf6

木虫 (小有名气)
不是B3LYP算金属不太好么？
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10楼2014-03-26 21:18:03
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