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bao86

铁虫 (小有名气)

[交流] PCR直接测序与克隆测序

PCR直接测序与克隆后测序有什么区别
测出来的序列有什么差异么?
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Sanger882

银虫 (小有名气)

直接测序优点是:方便快捷,节省时间,避免了转化,克隆方面的繁琐步骤;
         缺点是:产物不稳定,送样还要附带冰盒,纯度要求高,回收纯化的产物需要达到一定的浓度才能测序,而且还要自己提供特异性引物,精确度也受一定影响;

  克隆测序的优点是:产物保存在菌体的质粒里面,稳定,可常温直接送菌液测序,无需提供特应性引物,而且测序的精确度较高;
    缺点是:步骤繁琐,包括制作高效的感受态细菌,连接,转化,克隆子阳性检测等,中间任何一个步骤都不能出现问题;
    在选择测序公司方面个人感觉:上海英骏公司PCR产物直接测序做的比较好。
信念之火一旦燃烧,再大的暴风雨也无法阻挡!
14楼2008-05-18 11:07:39
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weiwei1

木虫 (小有名气)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
直接测序需要你提供引物,而且引物序列是测不出来的。克隆后测序可以使用载体的通用引物,可以测出引物序列。
2楼2008-02-25 09:53:05
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njlf1258

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
另外再加一个克隆测序的优点CR测序往往会有杂峰出现,这是PCR产物不纯和PCR时出现突变引起,而克隆了理论上就不会出现以上情况了。
4楼2008-02-25 14:30:32
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葬花人

铜虫 (初入文坛)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):xiexie 欢迎常来,.
理论上PCR产物直接测序是很理想的——机器读数时由于正确的碱基占多数,PCR过程中产生的错误不足以影响某一碱基位点的正确阅读,而且免了克隆到大肠杆菌这一步工。
而克隆到大肠杆菌后,平板上的菌落都是单克隆子,也就是说PCR产生的错误克隆子也杂在其中。
但事实上克隆后再测序比直接测序成功率要高,究其原因,无非是胶上看着是一条带的,却经常是不同序列的混合物。
花开易见落难寻
6楼2008-02-26 01:21:28
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