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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 分子模拟文件的转换软件！好用且免费！
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dxli75

铁虫 (初入文坛)

[资源] 分子模拟文件的转换软件！好用且免费！

分子模拟的软件较多，其相应的文件格式也较多！当相同体系在不同软件之间传递时，有时不能全部识别非常麻烦！
以前有个软件也很好用，但是要收费，好像是30美元！
现在这个软件是完全免费的，且几乎能识别所有格式的分子模拟文件！非常好用！
记住：使用前要首先设置可执行文件的路径！

不过有一个缺点，也可能是我还没有搞懂：hyperchem中建立的具有周期性的理想分子文件*.hin转换到MS中的*.CAR文件，周期性边界会消失！ 我为此郁闷了很久，喜欢该软件的行家，不妨试试，帮我找找原因！

多谢！

抱歉！附件上传不全！给大家两个网址去下载吧！
免费的BABEL:
http://www.ccl.net/cca/software/UNIX/babel/index.shtml
收费/可试用的Mol2mol：
http://web.interware.hu/frenzy/mol2mol/index.html

[ Last edited by wuli8 on 2009-6-13 at 21:06 ]
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1楼 2008-02-24 12:42:16
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spur

金虫 (正式写手)
*.car 文件的数据是笛卡尔坐标，MS难以找出对称性和周期性。如果能转成分数坐标就解决问题了。
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6楼2008-03-02 15:47:36
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dxli75

铁虫 (初入文坛)
第二、第三个附件：

[ Last edited by dxli75 on 2008-2-24 at 13:06 ]
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2楼2008-02-24 12:56:35
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yalefield

金虫 (文坛精英)
Babel是最基本的工具了，没啥新鲜的。
从网上可以得到最新的版本。
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3楼2008-02-24 13:10:07
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
是啊，为啥不提个 openbabel 呢？呵呵……
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4楼2008-02-24 13:54:43
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